源泉徴収票を会社が税務署に提出していなかった！
税金の事などにかなり疎いので皆様のお力をお貸し下さい。
20歳を超えてから毎年4期に渡り住民税を納付していました。
年収は460万円ですが、平成19年度の住民税は4期分で58,000円です。
この時点で、お詳しい方なら「住民税安すぎだろ！」って思われると思います。平成19年度より税率改正があり、税率について勉強を全くしていなかった為、それに気づかなかった私自身にも落度はあります。
今年、確定申告を自分の力で初めてしました。（前職では会社が年末調整をしていてくれた為）
私の今の状況としては
甲：フルタイム勤務でアルバイト（時給制）保険など一切無し
乙：実家の会社で役員（月給制）社会保険加入
で二ヶ所から給料が発生している状態です。
アルバイトの方は毎月所得税が給料の1割引かれている状態です。
今回平成19年度は確定申告をして払いすぎた所得税、約190,000円還付されました。
ここからが本題です。
2社の給料を合わせて年収は約460万円なのですが、今日区役所から納税通知書なるものが届き、「平成19年度該当分」として208,300円の納税用紙が入っていました。
税金に関して少しだけ詳しい方に聞くと、「甲であるアルバイト先の会社が源泉を税務署に提出していないんじゃないか？」と言われました。
実家（乙）には源泉提出の確認は取れていますので、乙は提出済みです。
要は平成19年度の支払い済み住民税は乙の会社の年収だけでの計算での58,000円だったという事です。
ですが、払うべき住民税が後になって来ただけで（確定申告した事により発覚）私自身払う意思はきちんとあるのですが、あまりの突然の出来事でビックリしたのと、アルバイト先の会社が税務署に源泉を提出していなかった（と思われる）事に怒りを感じました。
上記の通りだと、私が住民税を今まで脱税していた事になりませんか？
これから払うので脱税ではないでしょうけど、そのまま私が確定申告しなければずっと脱税しっぱなしだったという事になると考えると恐ろしい気分になりました。
ちなみにこの会社にアルバイト勤務し出してから2年半ですが、過去3年の確定申告もこの間したところで、平成18年度該当分については59,900円の納付書も届いています。私が今のアルバイト先に勤務して2年半、1度たりとも提出していなかったという事です。
ここで質問なのですが、
源泉を税務署に提出しなかった会社は、何故提出をしていなかったのか…です。提出しない事に対しての会社側のメリット・デメリットはあるのでしょうか？例えば「税務署に突かれたくない事実がある」など。
前回、所得税の件でも質問をさせて頂き、1割所得税で持っていかれている事に対し、「それにしても1割は取られすぎなので、税務署に言ってみては？」とのご回答を頂きました。
所得税1割徴収と源泉未提出の因果関係などはあるのでしょうか？
過去分（平成17・18年度分）の源泉徴収票を貰う時もかなり渋られましたし、今年の分の源泉徴収票もこちらから要求するまで出してくれないしで何だか甲の会社は信用できない事だらけです。
もし、何かあるのであれば本当に怒り心頭なのでこのアルバイト先を辞めてやろうと思っています。
皆様のお力をお貸し下さい。
宜しくお願い致します。
補足
当時の源泉徴収票は手元にあります。給与所得もありそのまま確定申告で提出をしていなかったという事なのですが・・・ 提出先は税務署でよろしいんですよね。