特許侵害・訴訟について

質問

開発の仕事をしているのですが、法律関係に疎いので質問させてください。。

企業１がＡという化学物質を新しく開発し製造方法と物質の特許を取得して製造販売しているとします。
しかし、その特許に記載の方法では確かにＡはできますが、事実上Ｂ（新規物質）が副生し、
ＡとＢの混合物（A : B = 1 : 1　もしくは　Ｂの割合が多い）となってしまうことがわかりました。
また、発明目的である製品の性能はＡよりもＢの効果が強いとします。

この事実に他社である企業2が気づき、Ｂだけを選択的に製造することができる手法を開発し、
新たにＢについての特許を取得したとします。（発明の目的、用途は両社とも同じ）

このとき、先に登録されたＡについての特許にはＢに関する記載が全くなかった場合、
企業2は企業1に対してＡの特許取り消しや製造の差し止め訴訟をすることができるのでしょうか

できれば関係法令や判例なども教えていただければ非常に助かります。
よろしくお願いいたします。