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PCRのサイクル
学生実験でPCRを行ったのですが、PCRについて質問です。 (1)94℃ 2分、(2)98℃ 10秒、(3)55℃ 30秒、(4)68℃ 50秒、(5)68℃ 2分、(6)4℃ の設定で(2)~(4)を30サイクル行いました。 (1)と、(5)の意味がわかりません。 (4)で68℃の反応をしているのに(5)でもう一度68℃ 2分を行うのは、急激に温度を下げるのを避けるためでしょうか? よろしくお願いします。
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(4)68℃ 50秒 を 伸張 と呼ぶなら (5)68℃ 2分 は 最終伸張です。 伸びきらなかったものをのばすため。 実際は(4) XX℃ XX 秒で増幅できるようにプログラムを組むので、(5)はおなじないみたいなものです。 (1)は一般的にはDNAを確実に1本差に変性させるため。 ホットスタート法の酵素を使っているのでしたらタックの活性化の意味もあります。
お礼
とてもわかりやすい説明をありがとうございます。 (5)は最終伸長なんですね、 (5)が必要という先生と必要ないという先生が居たのですが、そういうことなんですね。 ありがとうございました。