源泉徴収について

質問

小さな会社で今年から経理を担当しています。
退職者の源泉徴収票を作成しようとして気がついたのですが、
今年の１月から所得税の金額を間違えていました。
源泉徴収税額表の金額を給与総支給額（社会保険料等の控除をしていない）で計算していました。
多く徴収していたことになります。

10月からの給与は（給与総額－社会保険料等の控除）でちゃんとした計算をして、
年末調整で還付すればいいのでしょうか？

それと、源泉所得税の納期限の特例の承認を受けていますので、納付は７月と１月です。
７月に納めた金額は35,000円ぐらい多いです。
次の１月に納める時に、それを差し引いて納めてもいいのでしょうか？
それとも「源泉所得税の誤納額還付請求書」で還付してもらった方がいいのでしょうか？

回答No.3

hatamachi

厳密に言えば、
対税務署→７月納付分は過誤還付請求、翌１月は７月以降１２月までの
　　　　　本来の徴収分から年末調整分を差し引きして納付
対従業員→前回給与分までの差額は本人に還付、以後１２月給与までは
　　　　　正しい金額で徴収。本来の預り額にて年末調整。
対退職者→本人に返金、源泉徴収票の訂正の上、その徴収票にて本人が
　　　　　確定申告（または転職先で年末調整）
が正しい手続きの流れとなります。

今回の場合は、税務署に対して過大納付となっているため、仮に１月分で
調整を行って（後に発覚したとして）も、会社側に不利な形での調整と
なるため問題は無いのですが、過少納付の場合は問題があるため、ご留意を。