PCRを利用した性別判定

質問

最近PCRを利用した性別判定の実験をしました。その中で、AMEL遺伝子断片とSRY遺伝子断片をPCR法によって増幅しました。そこで、AMEL遺伝子の方のY染色体に存在する106bpsの断片が、増幅されるはずだったのですが、電気泳動の結果、バンドが現れませんでした。先生によると106bpsのバンドは現れにくいということでしたが、これはどうしてでしょうか？これだけの情報で質問に答えられるものなのかわかりませんが、できそうな方はどうかお願いします。

回答No.1

MIYD

質問文の情報だけから考えると、
AMEL遺伝子断片増えにくい配列なのではないでしょうか。

高次構造をとりやすい配列やGC含量の高い配列は増えにくい場合があります。

また、もしかしたら泳動しているゲルの濃度が適切でないためにAMELのバンドがうまく見えずに、
SRYのバンドが綺麗に見えたのかもしれません。