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ChIPシークエンスについて
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ChIP seqは直接配列を読み、ChIP on ChIPはチップ状にハイブリすることで評価するわけですから、感度、定量制ともにChIP seqの方が直接的で優れていると言えます。またChIP on ChIP は高等動物の全ゲノムを精密にかつ網羅的にしらべることがまだ困難であるのにたいし、配列をよむChIP-seqは基本的にはその制限はありまん。ただ日々進歩していますが、ChIP-seqのほうがまだその特性を最大限生かせるだけの解析ソフトが十分ではありませんのでその点が問題点です。 非常に簡単に述べましたのでご参考までに。
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