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シークエンスの波形をよくするには

DNAの配列決定(シークエンス)でやっているのですが,結果(波形)がどうも芳しくありません. ピーク強度,ピークの伸びが悪いです. キットはアプライドbiosystemのものです. 試薬はBigDye® Terminator v3.1,3100/3100-Avant™ Genetic Analyzer Autosamplerです.

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  • Chicago243
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回答No.1

いろいろな要素があるので一概にこれがいいとはいえません。 DNAのピューリティーとクオリティー(ニックが入っていないかとか)を確認および改善してください。 DNAの量は多いほどいいですABIのプロトコールに書いている量の3倍ぐらいおおくてもいいと思います。 BIGDYEは稀釈して使ってますか?1段階濃くしてみてもいいかもしれません。プライマーもかえることで改善する可能性があります。シーケンスが特殊な構造を取りやすい場合は読めるところまで読んで、あきらめて裏を読むとか工夫が必要です。

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