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2つのシークエンスによる結果の違い
RNase_Pの回答
- RNase_P
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クローニングしてから調製したプラスミドは 基本的に均質なものと考えられます。 それに対してPCRダイレクトシーケンスの場合、 PCRの非特異的増殖や増幅時の変異などにより 鋳型自体が均質とは言えません。 そのためシーケンスの波形データ自体の質は劣ることも多いと思います。 配列既知のもののサブクローニングでは問題になりませんが 新規配列の解析の場合、クローニング経由の場合1クローンの 配列が綺麗に読めたからと言って、それが"正しい"配列だ と言うことにはなりませんので気をつけてください。
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