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凍結乾燥時のDNAの状態について
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フィルム状のサンプルになったのは乾燥の途中で氷が溶けて液体になってしまったためだと思います。凍結乾燥じゃなくて、エバポレーターでDNA溶液を乾燥させた状態になったんじゃないですか？
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- geneticist12
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不純物の含み方が違うのかもしれません。MASSにてもかければ、簡単に不純物を検出して比較できるのではないかと思います。 もっとありそうかなと思うのは、結晶水の残り方が違うのではないかなと。 減圧乾燥すると結晶水を失い、溶解しにくくなったり、二本鎖DNAの場合は解離してしまったりします。合成機で合成したオリゴDNAなら別ですが、普通のDNAならエタノール沈殿で回収して、沈殿は自然乾燥するのが良いです。
お礼
ご回答ありがとうございます。 念のため、異なる状態のサンプルを再度水に溶解させ、MASS見てみました。 しかしながら不純物と見られるピークは見あたりませんでした。 とはいえ手持ち技術はMALDI-TOF-MSですので、正電荷帯びてたり 補足できないほど高分子のものなら見逃してる可能性はありますが。 二つ目にご回答頂いた結晶水の残り方はかなりピンと来るモノがあり 同じ研究室で実験してる人に確認取りました。 どうやら白い粉が出来た時は、私がドライダウンしている間に 自分のサンプルを入れるため、装置を一旦停止していた様です。 一方、フィルム状にドライダウンされたサンプルは 私が深夜に掛けたものであり、誰も手を触れる機会がなかったことが分かりました。 理由は分かりませんが完全にドライダウンが終わってない状態で 装置を止めると、白い粉状になる・・・というのが一番有力でしょうか。 相互作用の状態が異なってしまう原因は未だ不明ですが 疑問が一つ解消されたように思います。 ご回答ありがとうございました。
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