遺伝子のORFより上流の領域の検索について

質問

遺伝子の相同性検索ですが、コード領域はDDBJなどでホモロジーサーチをかければよいのですが、ORFより上流の領域（プロモータ配列）などはどこかにデータベースがあるのでしょうか。
ある遺伝子の上流を単離したのですが、どういうモチーフがあるかなどを知りたいのです。（どこにTATAboxがある可能性があるか、などの情報が欲しいのです）
ご存じの方おりましたら、よろしくお願いします。

回答No.2

robita

sabakanさん

　TFBINDならTATA boxなどの位置は把握できると思うのですが。
>TFBIND : Software for searching transcription factor binding sites (including TATA boxes, GC boxes, CCAAT boxes, transcription start sites (TSS)).

　あと、自分でモチーフを探したい場合は「YEBIS」が使えるのではないかと思います。ただ、こちらのほうは登録が必要で私も使用したことがありません。

　TFSEARCH、TFBINDも研究室で自分のグループに割り振られた学部生、M1相手の教育用に言及した位で研究用には使用していないです。探せば、もっと良いデータベースがあるのかも知れません。sabakanさんが急ぎのようなのでレスを付けてみた次第です。

お礼

たびたびご丁寧な返信、ありがとうございました。
TATA配列なども見いだせました。
（うっかり見落としてしまっていました。m(_ _)m )
重ね重ね御礼申し上げます。