タンパク質名からの遺伝子座・塩基配列の決定。

質問

タンパク質の名前だけから、コードする遺伝子の位置・その塩基配列を検索するには、またそれが既知であるかどうかを調べるにはどうしたらよいのでしょうか？
今はKITというタンパク質をコードするc-kit遺伝子の位置を知ろうとしています。
回答よろしくお願いいたします。

回答No.1

Mr_Spock · ベストアンサー

要は、遺伝子、タンパク質の配列のデータバンクや文献を検索すればいいだけなんですけれど。便利なのはNCBIのEntrezで、ここに検索語（c-kit）を入れれば、
データバンクに登録された遺伝子、アミノ酸の配列データベース（Genbankなど）、文献データベース（PubMed）などなど、一気に検索結果を出してくれます。遺伝子のマップ位置なんかはGenbankの配列情報（annotation)としても出ているかもしれませんが、OMIMというヒト遺伝子のメンデル遺伝学的な情報のデータベースを参照するといいでしょう。

参考URL：

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gquery/gquery.fcgi?term=c-kit

お礼

アドバイスどうもありがとうございます。
早速ためしてみます！