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転写因子の結合配列
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- geneticist12
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データの蓄積が進んだ現在では、一覧表のような形式では存在しないか、あっても不完全なものだと思います。また結合配列も頻度の違うバリエーションが存在し、一対一の対応表のようなものでは表現できないので、flat dataは頻度の重みを考慮したマトリックスになっていて、それなりのインターフェースがないと読みとりにくいです。 従って、検索サイトを利用するのが最善だと思います。 http://jaspar.cgb.ki.se/ http://www.cbil.upenn.edu/cgi-bin/tess/tess 使い方は、サイトの説明をお読みください。前者ではflat dataのダウンロードもできるようです(core配列のデータは一覧として使えるかも)。
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