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転写因子の結合配列
転写因子の結合配列が一覧になっている、または転写因子の名前などから結合配列が簡単に検索できるサイトをご存知有りませんか？よろしければ教えて頂けないでしょうか。
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- geneticist12
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回答No.1
データの蓄積が進んだ現在では、一覧表のような形式では存在しないか、あっても不完全なものだと思います。また結合配列も頻度の違うバリエーションが存在し、一対一の対応表のようなものでは表現できないので、flat dataは頻度の重みを考慮したマトリックスになっていて、それなりのインターフェースがないと読みとりにくいです。 従って、検索サイトを利用するのが最善だと思います。 http://jaspar.cgb.ki.se/ http://www.cbil.upenn.edu/cgi-bin/tess/tess 使い方は、サイトの説明をお読みください。前者ではflat dataのダウンロードもできるようです（core配列のデータは一覧として使えるかも）。
お礼
大変参考になりました。このようなサイトを探していました。どうもありがとうございました。