酵素反応について

質問

度々、申し訳ありません。

酵素の反応速度についての論文を読んでいたところ、ラインウェーバー・バークプロットが、どうしても理解できません。

酵素活性に対抗する基質濃度の逆数プロットをコンピューターで解析したとあり、論文中に出てくるその数値をみるとその研究で述べられている考えにあてはまるのですが、図式の見方を忘れてしまっているので、その論証が正しいのか否かということがわかりません。

詳しく書きますと、２つの異なる濃度の触媒を加え、その酵素活性を調べているのでラインは２本あります。
１つは触媒が少なく、もうひとつは適性濃度です。
基質の濃度は同じで、基質濃度はX軸、酵素反応物をY軸にとっています。
図表では触媒濃度が低いときのラインが上、触媒濃度が高い場合が下になっており、さらにその２本の線は途中で交差しています。
私は触媒濃度が高い方が上に、少ない方は下になるように思うので、どうしても納得がいきません。

このプロットの正しい見方、および交差をしているわけなど教えていただけるとありがたく思います。
よろしくお願いいたします。

回答No.2

rei00 · ベストアンサー

Lineweaver-Burk プロットが出ているページ（↓）がありましたのでご覧下さい。

　中程の「Lineweaver-Burkの式」からリンクされているページに図があります。また，下の方の「阻害様式の決定」からリンクされているページには阻害剤存在下でのグラフがあります。御質問の内容だと，こちらの方が当てはまるかもしれません。

　ところで，御質問文の用語に誤りがあり，質問内容がわかり難くなっています。次の様に解釈しましたが，合っていますでしょうか。

> 触媒
　「触媒（catalyst）」ではなくて「阻害剤（inhibitor）」だと思います。

> １つは触媒が少なく、もうひとつは適性濃度です。
　「適性濃度」とは何でしょうか？
　単に２種類の濃度の阻害剤存在下で測定を行なったということだと思います。

> 基質の濃度は同じで、基質濃度はX軸、酵素反応物をY軸に
> とっています。
　合っていますか。Lineweaver-Burk プロットであれば，Ｘ軸は「基質濃度の逆数（1/[S]）でＹ軸は反応速度の逆数（1/v）です。お書きのものが合っていれば，「Lineweaver-Burk プロット」ではなく別のプロットになりますが・・・。

> このプロットの正しい見方、および交差をしているわけ
> など教えていただけるとありがたく思います。
　私が書いているもの（参考 URL のサイトにある物）であれば，交差の仕方から阻害剤の阻害様式がわかります。

　ところで，
> 酵素の反応速度についての論文を読んでいたところ、
　と言う事でしたら，簡単なものでも良いので，生化学の教科書を一冊手元に置いておかれた方が良いかと思います。この程度の事は，どの教科書にも出ているはずですので。

　生薬の酵素阻害活性成分の研究を行なった事がありますので「経験者」としておきますが，お書きのグラフが私が考えているものと同じかどうか解りませんので『自信なし」です。

参考URL：

http://biomol.gifu-u.ac.jp/~molbiochem1/practicum/kinetics.html

補足

詳しい回答とご指摘ありがとうございました。
基質も逆数、反応速度も逆数で、ご指摘の通りでした。

rei00さんのURLを拝見させていただきましたが、交差しているところが第一象限なのですが、この場合はどうなのでしょうか？
再度お願いいたします。

回答No.3

rei00

rei00 です。補足拝見しました。

> 交差しているところが第一象限なのですが、
> この場合はどうなのでしょうか？

　スミマセン，私もハッキリとは申せません。

　その交差している場所は，第一象限でもｙ軸に近い部分（殆どｙ軸上）じゃないでしょうか。それでしたら，タマに見る事がありますが，気にしなくて良いと思います。

　今回は本当に「自信なし」です。

お礼

rei00さん、何度もありがとうございました。
y軸上ならば・・・とのことでしたが、残念なことにy軸には遠い感じです。
第１象現のど真ん中という感じなのです。

気にしなくてよいということなので、気にしません。
現在の研究が酵素を使って行う研究なので、またアドバイスをいただくこともあるかと思います。
どうぞよろしくお願いいたします。

回答No.1

nao0_0nao

Lineweaver-Burkのプロットということでしたら、
X軸が基質濃度の逆数、Y軸が反応速度の逆数になってるはずですが。。。

Y軸が反応速度の逆数ということに注意すると、
触媒濃度が高い方（ここでは適正濃度）が下になると思います。

お礼

早速の回答ありがとうございました。
基質の逆数、反応速度の逆数という意味がわからなかったのですが、
理解できました。