計算化学について質問です。

質問

こんにちは。
計算化学の事なのですが、この分野でやることの一つに、分子の動きをスパコンに計算をさせると聞きました。

実はスパコンの事もよくわからないのですが、自分で作ったプログラムを自分の大学のスパコンにネットで送って計算をさせるということでよろしいでしょうか？
また、計算をさせる前に自分の作ったプログラムにミスがないかを確認することはできるのでしょうか？

回答No.1

101325 · ベストアンサー

> 自分で作ったプログラムを自分の大学のスパコンにネットで送って計算をさせるということでよろしいでしょうか？

はい。そんな感じです。

> 計算をさせる前に自分の作ったプログラムにミスがないかを確認することはできるのでしょうか？

大学ごとに違うと思うので、大学の計算機センター(情報基盤センター)のスパコン利用者登録を担当している部署に尋ねるか、センターのホームページにある、利用の手引きやFAQを見るのが確実です。

ふつうは、スパコンのほかに、スパコンを使うほどでもない計算をするためのアプリケーションサーバや汎用サーバ（スパコンを利用するためのフロントエンドサーバがアプリケーションサーバをかねている場合もあります）がセンターに設置してあります。スパコンで計算する前にこれらの計算機でプログラムを走らせれば、プログラムにミスがないかを確認することができると思います。

計算によっては、利用負担金が安いアプリケーションサーバで十分なことも多いですから、スパコンの利用者登録をするときに尋ねてみてください。利用者登録の担当者からその場でアドバイスをもらえることはさほど期待できませんが、詳しい人に取次いでくれるはずです。

お礼

ご回答ありがとうございます。

スパコンに計算させる前にチェックが出来ると聞けて安心できました。

やはりスパコンは利用料がかかってしまいますか。。。
研究室に備え付けのスパコンがあればかからなくていいんですけどねぇ。

本当にありがとうございました。