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ホモログ検索

酵母の蛋白、She3pのXenopusでのhomologueを知りたいのですが、どこかホモログを検索できるページとかありませんでしょうか?

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noname#4684
noname#4684
回答No.1

ゲノムネットの中の,ブラスト(BLAST)を使えば,もしデータベースに登録されていれば出てきます. 下記アドレスをクリックして飛ぶページの,画面中央のやや上に,「BLAST」とあるのでここをクリックしてください. 黒丸を,BLASTN,nr-nt,にクリックしていれて,酵母のShe3pの塩基配列を「Enter your query sequence below (copy & paste):」にコピペしてください. Execをおすと,サーチ結果が出てきます.結果はたくさん返ってくるので,自分で「ゼノパス」の「She3p」を探してください.

参考URL:
http://www.genome.ad.jp/Japanese/
aguitar
質問者

お礼

すみません、忙しかったのでついつい忘れておりました。 She3pに似た配列はついに見つかりませんでしたが、そのかわり他の数タンパクに似た配列はBLASTで見つけられました。 ありがとうございました!

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