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原因菌の検出と推定原因菌の検出はどう違うの？
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文脈がわからないので推定ですが、 特殊な培養法（嫌気培養など）を採用しないと検出できない細菌があります。 それらの細菌の関与が疑われるときにははじめからそれを推定して 特殊な培養法で検出を試みるわけです。 それが推定原因菌ということではないかと思います。 ですから推定原因菌の見込みが当たって特殊な培養で検出されれば同定できます。
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