エドマン分解法について

質問

ペプチドAをトリプシンで処理すると３つのペプチドに分解しエドマン分解法でアミノ酸配列を決定したところ以下のようになった。
(1)Tyr-Gln-Glu-Val (2)Ser-Thr-Phe-Arg (3)Phe-Cys-Trp-Lys

一方ペプチドAをキモトリプシで処理すると４つのペプチドと1つのアミノ酸に分解し、エドマン分解法でアミノ酸配列を決定したところ以下のようになった。
(1)Cys-Trp (2)Lys-Ser-Thr-Phe (3)Arg-Tyr (4)Gln-Glu-Val (5)Phe
ペプチドAのN末端アミノ酸、C末端アミノ酸、　N末端より六番目のアミノ酸はなにか？

とゆう問題なのですがいろいろ調べたのですがわからないです。
まずエドマン分解法とキモトリプシンとトリプシンが鍵だと思うのですがどのようにして解いていけばいいのでしょうか？
どなたかご教授ねがいます。　よろしくお願いいたします。

回答No.1

aika0915 · ベストアンサー

とりあえず、このペプチドは

Phe-Cys-Trp-Lys-Ser-Thr-Phe-Arg-Tyr-Gln-Glu-Val

ですね。パズルのように考えます。
例えば、トリプシン処理の(2)の注目するとSer-Thr-Phe-Argとなっていて
キモトリプシン処理では「Ser-Thr-Phe」の並びがあるのは(2)だから、この最後にはArgがくるため、(2)の次は(3)が来る

といった考え方でペプチドの並びが分かります。

そして、一般的にはペプチドはN末端を左に向けて書くので・・・

回答No.2

owata-www

アミノ酸配列は基本的に
Ｎ末端→…Ｃ末端
と書きます

また、エドマン分解はＮ末端側からアミノ酸配列を特定することができます（今回は関係ないですが）

トリプシンはリシン（Lys）、アルギニン（Arg）のＣ末端側のペプチド結合を加水分解します、だから、(2)、(3)のＣ末端側はArg、Lysになっていますよね

キモトリプシンはトリプトファン（Trp）、フェニルアラニン（Phe）、チロシン（Tyr）などの芳香族アミノ酸のＣ末端側のペプチド結合を加水分解します

あとは組み合わせを考えればわかるかと