アミノ酸配列決定の問題です。

質問

よろしくお願いいたします。問題は、
グリシン、メチオニン、リシン、フェニルアラニンが直鎖状に結合した化合物であるテトラペプチドAがある。このアミノ酸配列順序を決定するために次の実験を行った。

1, 塩基性アミノ酸のカルボキシル基で形成されるペプチド結合のみを加水分解する酵素でAを処理したところ、α-アミノ酸が３個結合したトリペプチドBと不正炭素原子をもたないα―アミノ酸cに分解された。

2, Bを酸により部分的に加水分解したところ、DとEの二種類のジペプチドが得られた。このうちDはキサントプロテイン陽性で、Eは陰性である。

3, Ａに濃水酸化ナトリウム水溶液を加えて加熱した後、酢酸鉛(II)水溶液を加えたところ、黒色沈殿を生じた。
問題: テトラペプチドAの配列順序について、結合に関与していないα―アミノ基をもつアミノ酸が左端になるように記せ。

ここで一つ目の質問です。問題文の2のところの「DとEの二種類のジペプチドが得られた」です。ｂはトリペプチドなので、それを加水分解したら、ジペプチドはDEどちらか一方だけですよね？この書き方だと、両方ジペプチドかと思うのですが。

もう一点質問は、
私がわかったのは、テトラペプチドのアミノ酸を左から1,2,3,4とすると、一番右の４がＣ-グリシン、3がリシン、です。残り二つはフェニルアラニンとメチオニンとわかったのですが、この二つの順番がわかりませんでした。

解答は、「キサントプロテイン反応より、ジペプチドｄはフェニルアラニンを含むがジペプチドEはフェニルアラニンを含まないことから、フェニルアラニンは2の位置にはない」とあるのですが、この意味がわかりません。「～から」まではわかりますが、どうしてそれがフェニルアラニンが２の位置にないということになるのでしょうか？

よろしくお願いいたします。

回答No.1

Kemi33 · ベストアンサー

【１つ目の質問】
　質問者さんがお書きの様に，テトラペプチドのアミノ酸を左から 1, 2, 3, 4 とします。つまり，テトラペプチドＡは「1-2-3-4」で，トリペプチドＢは「1-2-3」です。

　ここで，トリペプチドＢにはペプチド結合が「1-2間」と「2-3間」の２つあります。『Bを酸により部分的に加水分解』した場合には，「1-2間」で加水分解されて生じるジペプチドと「2-3間」で加水分解されて生じるジペプチドが混ざる事になります。

　結果，「1-2間」で加水分解されて生じるジペプチド「2-3」とアミノ酸1，「2-3間」で加水分解されて生じるジペプチド「1-2」とアミノ酸3，が生じる事になり，ジペプチドは「1-2」と「2-3」の２種類できます。

【２つ目の質問】
　上で書いた様に，ジペプチドＤ，Ｅは「1-2」と「2-3」です。

　ここで，『ジペプチドＤはフェニルアラニンを含むがジペプチドＥはフェニルアラニンを含まない』を良く考えて下さい。フェニルアラニンはＤとＥの一方にしか含まれていないという事です。

　したがって，Ｄ，Ｅの両方に含まれる「2の位置」はフェニルアラニンでは無いという事になります。

お礼

ご丁寧にご回答いただきありがとうございます。

目からうろこでした。。。
ｂを分解すると、二種類のジペプチドができるのですね。
それならわかりました！
一つ一つの疑問をもった段階でわからないならともかく、二つの疑問を組み合わせれば、推測できたかもしれない、、、。

まだまだ練習不足です。ご回答ありがとうございました。大変参考になりました。