- ベストアンサー
たんぱく質断片から遺伝子を探索する方法
生体から得られたたんぱく質断片(ペプチド)から、そのたんぱく質をコードする遺伝子を探索するための方法を教えてください Gly-Leu-Pro-trp-Glu-Asp 正直、テストの過去問です 急いでいるので簡単でもいいので教えていただければ自分で調べますのでお願いします
- sirasu1985
- お礼率12% (1/8)
- 生物学
- 回答数3
- ありがとう数0
- みんなの回答 (3)
- 専門家の回答
質問者が選んだベストアンサー
私も、回答no.2の方と同じ意見です。アミノ酸やDNA配列の情報が貯蔵されたデータベースでBLASTと呼ばれるサイトを利用します。検索したいアミノ酸やDNA配列を指定の場所に記入すると、Googleでキーワードを検索する要領で、同じor似ている配列を持つタンパク質や遺伝子を似ている順にリストアップしてくれます。 または、目的のタンパク質断片を持つ生物がわかっているのであれば、個々の生物のデータベースで検索する方法もあります。ただし、そのときは目的の生物のゲノム配列が、ある程度明らかとなっていてデータベースが存在していないといけません。例えば、研究用モデル植物として使用されるシロイヌナズナは全ゲノム配列が明らかとなっており、データベースで検索が可能です。
その他の回答 (2)
- Chicago243
- ベストアンサー率38% (401/1043)
すいません。追加です。タンパクのシーケンスがら、核酸をホモロージ検索することもですます。
- Chicago243
- ベストアンサー率38% (401/1043)
可能性のあるコドンの組み合わせで、ホモロジー検索してください。もしゲノムプロジェクトが終了していない生物の場合は、そのシーケンスをプローブにcDNAなどからスクリーニングすることになるでしょう。 http://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%82%B3%E3%83%89%E3%83%B3
関連するQ&A
- アミノ酸の性質について
タンパク質の立体構造は基本的に20種類のアミノ酸から構成されている。その20種類のアミノ酸(Asp,Glu,Lys,His,Arg,Ala,Leu,Ile,Met,Val,Phe,Trp,Pro,Asn,Cys,Gln,Gly,Ser,Thr,Tyr)それぞれの性質について教えてください。 例えばMet(メチオニン)はタンパク質を合成する。性質と、どの基があるからその性質を示すのか?も詳しく教えてください。
- 締切済み
- 生物学
- アミノ酸配列によるタンパク質の機能の予測
Leu-Ala-Asp-Phe-Ile-Glu-Lys-Leu-Leu-Ser-Val-Ala-Lys-His-Leu-Ile-Asn-Glu-Val-Ser-Arg-Leu この配列をもつ蛋白質の予想される機能とは何でしょうか?
- ベストアンサー
- 生物学
- アミノ酸の分類について
タンパク質の三次構造を安定化するアミノ酸側鎖の間の相互作用は、主として疏水結合、水素結合、塩橋、共有結合のいずれによるものか分類しなさい。 アミノ酸:ala asn cys gln gly Ile Leu met phe pro ser thr trp tyr val asp glu arg his lys この様な問題を出されたのですが、どの様に分類すればよいのでしょうか? 解答をお願い致します
- 締切済み
- 化学
- 遺伝子側とタンパク質側、双方からのタンパク質の構造決定について、抗原抗体反応を利用した分析方法について
テストで次の内容が出たのですが、答えられませんでした。気になって夜も眠れません。回答お願いします。 問)現在では、誰でもWeb上から各種データベースにアクセスしてタンパク質をコードする遺伝子の塩基配列を基にしたタンパク質の一次構造を比較的容易に推定できる。しかしながら、タンパク質そのものを生体から単離して構造決定することは非常に重要である。なぜ、遺伝子側だけでなく、タンパク質側からも構造決定する必要があるのか?理由を述べなさい。 問)抗原抗体反応を利用した様々な分析は、生命科学研究で欠くことができないほど重要である。抗体を利用した分析方法を挙げ、原理を簡単に説明しなさい。
- ベストアンサー
- 生物学
- 遺伝子をノックアウトしたマウスの作り方
マウスの血中からNH2-Mer-Ala-Pro-Trp-Trp-COOHというペプチドがあったとします。 このペプチドの機能を調べるためにこのペプチドをコードする遺伝子をノックアウトした マウスを作りたい場合どうすればよいでしょうか?
- 締切済み
- 生物学
- タンパク質の構造決定
現在、タンパク質をコードする遺伝子の配列を基にして、タンパク質 の1次構造が比較的容易に推定できます。でも、タンパク質そのものを生体から単離して構造決定することも盛んに行われています。どうして遺伝子側だけでなくタンパク質側からも構造決定する必要があるのですか?
- ベストアンサー
- 生物学
- 人工遺伝子の構築について
自分の研究で扱いたいタンパク質をコードする遺伝子を、オリゴヌクレオチド断片を用いて構築したいと考えています。 業者の受託サービスを利用することも検討しましたが、料金がとても高いので、自分で構築したいと考えています。 そこで質問なのですが、人工的に遺伝子を構築する方法が記載された論文あるいは参考書をご存知でしたらご教授いただけると幸いです。よろしくお願いいたします。
- 締切済み
- 生物学
- 遺伝子の化学合成法について
はじめまして。生化学の研究室に所属している学生です。 自分の研究で、目的タンパク質をコードする遺伝子を化学合成によって取得し、発現ベクターに挿入した後、大腸菌等でタンパク質を発現したいと考えています。 方法として、目的タンパク質をコードするDNAを、いくつかのオリゴヌクレオチド断片として合成し、DNAポリメラーゼを用いてPCRによって構築するという概略は知っているのですが、詳細な方法が分りません。この方法が載っている文献(論文、参考書など)を知っておられましたら、教えてください。よろしくお願いいたします。
- 締切済み
- 生物学