- ベストアンサー
タンパク間相互作用
- みんなの回答 （1）
- 専門家の回答
質問者が選んだベストアンサー
ターゲットのタンパクが決まってるならco-IPで問題ないかと。特異抗体は必要ですが、two-hybridよりも正確です。抗体がないなら、タグつけてpulldown assayかな。相互作用によっては、IPなどの処理で相互作用が切れることもあるので、方法の検討は必要です。 もっと前段階で、とりあえずスクリーニングします、ってならtwo-hybridのほうが効率が良いみたいです(私はやったことないですけど)。ただ、酵母を使うので、培養系が確立していないと、立ち上げはメンドイでしょうね。擬陽性も多いみたいですし。 あるいは、FRETとかFCCSとか。 http://www.riken.jp/r-world/info/release/press/2006/060501/detail.html あと、私の同僚は、Duolink in situ PLAってのをやってました。 http://www.nacalai.co.jp/products/recommend/olink3.html どちらも、in situで見れるのがよさそうです。
関連するQ&A
- タンパク質相互作用を調べる
現在あるタンパク質についてどんなタンパク質と相互作用しているか（homodimerを含めて)を簡単に調べる方法を探しています。数個のものを調べるのなら論文を読めば済むのですが、100以上の蛋白質について調べようとしているためこの作業がかなり大変です。何かいいデータベースでもないでしょうか？
- ベストアンサー
- 生物学
- 共免疫沈降でのfigure
共免疫沈降を行ったというfigureで分からないことがあります。 ○○タンパクと××タンパクとの相互作用を調べるために、共免疫沈降を行っている論文があるんですが・・・ IP,α××；Blot,α○○ Lysate;Blot,α○○ 上のような表記の時、 (1)αは何を表しているのか。いづれも目的とするタンパク名の前に表記されています。 (2)全体として一体何を表しているのか。 これだけじゃ分からないのかもしれませんが・・・
- ベストアンサー
- 生物学
- 分子間相互作用・タンパク質の精製法
こんばんは。 分子間相互作用とタンパク質の分離精製方法、一次構造決定法(実際に実験したことはありません)で質問があります。 (1)疎水性相互作用は溶媒が水の場合のみ形成されるのでしょうか？ 極性溶媒なら可能なのでしょうか?ヘキサンなどの有機溶媒は極性がないので形成されないのでしょうか? (2)分離精製されたタンパク質は未変性タンパク質なのでしょうか？ いろんなことをやっているうちに変性してしまうような気がするのですが・・・。 (3)硫安分画では溶解度を利用したものですが、それはタンパク質の分子量に関係しているのでしょうか。(タンパク質の分量が大きいほど低い硫安濃度で沈澱するのでしょうか？) (4)MS/MSは大きいタンパク質をそのま打ち込むことによって一次構造が決定できるという問題があったのですが、そのまま打ち込むということはどういうことなのでしょうか?ゲノム情報なしに～という意味なのでしょうか？ 長くなりましたがよろしくお願いします。
- 締切済み
- 化学
- 蛋白相互作用解析の材料について
蛋白・蛋白間の相互作用解析の機器のデータ取りをしたいのですが、適当な蛋白質の対を教えてください。 Kdが10の-7から8乗程度、市販で安価に手に入る組み合わせがほしいのですが。抗原蛋白（たとえばＢＳＡ）とそれに対するモノクローナル抗体が解析には適しているのですが、モノクローナル抗体は高価なので、予算的に厳しいのです。 何かよい組み合わせをご存知の方は教えてください。
- 締切済み
- 生物学
- 疎水性相互作用とエントロピー
タイトルのとおり、疎水性相互作用とエントロピーについてなやんでいます。 蛋白質で疎水性相互作用が働く理由はエントロピーがかかわっていますよね？ 詳しい理由がわからないのでお願いします。
- ベストアンサー
- 生物学
- 時間ごとに固体粒子の沈降量を測定→粒子間の相互作用
１．時間ごとに固体粒子の沈降量を測定すれば粒子間の相互作用を求めることができる。 ２．時間ごとに固体粒子の沈降量を測定すれば粒子間の粒度分布を求めることができる。 上記2つのの記述は正しいですか？間違っていますか？ 間違っていましたら、解説もよろしくお願いします。
- ベストアンサー
- 物理学
- 配置間相互作用(CI)
分子軌道法において、分子間結合を考える時 結合エネルギーは共有結合項とイオン結合項の和で表される。（あってます？） この時、水素分子であれば前項に比重がかかり NAClのようなもので後項に比重がかかると教わりました。 で本題ですが この比重を論ずるのが配置間相互作用だと教わったのですが いまいち配置間相互作用(CI)がどのようなものか理解できませんでした。 またこの作用は分子軌道法がイオン項を過大視しているのを補正する役目もあると 教わりました。いったいこの配置間相互作用とはなんなのか 簡単に教えてください
- 締切済み
- 物理学
- 免疫系・神経系・内分泌系の相互作用について教えてください。「マロファー
免疫系・神経系・内分泌系の相互作用について教えてください。「マロファージが産生するサイトカインが免疫系だけではなく、神経系と内分泌系の機能を調節している」と聞きます。具体的な事例（因果関係）と、わかりやすい書籍を教えてください。
- ベストアンサー
- ヘルスケア(健康管理)
- あるタンパク質が結合する他のタンパク質の同定法
生物学をかじっている者です。分子生物学の実験で、あるタンパク質の機能を調べる際、それが他のどのタンパク質と結合するのかを調べる一般的なやり方が知りたいです。 私は、Far western blotting、免疫沈降、アフィニティークロマトグラフィーといった専門用語を単語としては知っている、個々の意味を調べれば理解出来る、というレベルなのですが、そういった手法を行う具体的な順番や、どういった手法がメジャーなのかがよくわかりません。大雑把でいいので教えて頂けないでしょうか？
- ベストアンサー
- 生物学
