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ジスルフィド結合を多数(15以上)持つ蛋白質をトリプシン消化しています
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- ga111
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もしかして、ターゲットのLys、Argがほとんどない蛋白ということはありませんか?Lys、Argが少しだけあっても何らかの理由で切れないこともあると思います。 還元剤+変性剤はどうでしょう? この同じ条件で他の蛋白(BSAなど)を使い、切れるというポジティブコントロールは取りましたか? キモトリプシン、Proteinase K など、違うプロテアーゼで、切れるということは確認しておくといいかもしれません。
- ga111
- ベストアンサー率26% (247/916)
実際のプロトコールは知りませんけど、DTTでジスルフィド結合を還元してやったらどうでしょう? 変性剤もいいかも。両方とも、消化前、消化中とかも検討します。
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