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ゲノムの電気泳動
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普通のアガロース電気泳動でも、O.3%くらいのゲルなら100 kbくらいまでは分離できます。ゲル強度が高く、電気浸透度の低いクレードのアガロース（パルスフィールド用のアガロース）を使うといいでしょう。
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参考になりました。 ありがとうございます。