ゲノムサイズの調べ方

質問

おおよそのゲノムサイズが文献に載っていたりしますが、それはどうやって調べているのでしょうか？

ゲノムを電気泳動した時の結果から推測しているのでしょうか？

回答No.1

noname#250373 · ベストアンサー

電気泳動ではらちが明かないですよね（汗
私も気になったので調べてみました。

かつてはDNAを抽出・定量し、１細胞あたりDNA量を推定、
１塩基あたりの分子量で割り算することで塩基対の数（＝サイズ）を算定していたそうです。

最近はより簡便な方法として、フローサイトメトリーが利用されています。
細胞をバラして、核酸を染色する蛍光色素(Propidium Iodide)などで細胞を染色し、
フローサイトメトリーで１細胞ごとに蛍光強度を測定することでDNA量を推定しているようです。

おまけ１：ゲノム＝ひと揃えの遺伝子セット。生殖細胞(n)のDNA、または体細胞(2n)の半分のDNA量に相当する。
このため、測定に使用する細胞が体細胞ならDNA量を半分として扱う必要がある。
おまけ２：性染色体のサイズの違い（性差）、分裂途中の細胞（DNA量の増加）といった変動要素を考慮に入れる。

お礼

回答どうもありがとうございます！
おまけも解説して戴いて、とってもわかりやすいです。（＾＾＊）

なるほど～・・蛍光色素の強度で推定するのですね。
すっごく便利ですね。本当にすごい！

素早く的確な回答どうもありがとうございました！