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ファイル名が「abc.txt」として set FILELINES=`cat abc.txt` とすると $FILELINES[1]に$DIR1/$FILE1 $FILELINES[2]に$DIR1/$FILE2 $FILELINES[3]に$DIR1/$FILE3 が入り、$#FILELINESに個数が入ったと思います。 環境がないので検証はしていません。
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できました。 ありがとうございました。