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configure コンパイルオプションの調査方法
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ケースバイケースといえばそうですけどapacheやMySQLなどは ソースと一緒にREADMEやINSTALLといったテキストファイルに書かれてると思いますが。 configureがあるなら $ ./configure --help でも指定可能なオプションなどは表示されますし。
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configure があるなら、 configure --help でいけるんですよね。 その他の場合は公式ドキュメントなどあたるしかなさそうですね。