Ｒのメッセージ抑制

質問

統計言語Rのクレジット表示とか警告とかがうるさくてたまらないので、
perlのように出力指定したもの以外一切表示しなくするようにする方法を教えて下さい。
suppressWarningsとかsuppressMessagesはコマンド毎にかかないといけないので、
そうではなく、グローバルな初期設定として、一括して表示抑制ができる方法があると嬉しいです。
よろしくお願いします。

回答No.2

ki073

No.1です。もしPerlなどのスクリプト言語からRを使いたいのでしたら、それ用のモジュールが有ったりします。

Perlを使わないので、詳しいことは分かりませんが、
http://www.okada.jp.org/RWiki/?Perl%A5%B9%A5%AF%A5%EA%A5%D7%A5%C8%A4%AB%A4%E9R%A4%F2%B5%AF%C6%B0%A4%B9%A4%EB

が参考になるかも知れません。

RubyからRをよく使っているのですが、その時はrsrubyを使用しています。
この場合は、Rからの不必要なメッセージは完全に押さえられます。

回答No.1

ki073

OSを書いていないので一般的な回答を

以下を参考にしてください。

http://papaya.ab.a.u-tokyo.ac.jp/groups/biomet/wiki/026b4/R.html

-qでも出力が抑制されます。

OSXのpkgからインストールした場合はそのままではうまく動きません。(どうもGUIと一緒になったプログラムのようです)
MacPortsなどで、Rをインストールすれば正常に動きます。

お礼

ありがとうございました。

補足

結局以下のようなことをして無理矢理解決しました。

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#!/usr/bin/perl

$ar=@ARGV[0];

if($ar eq ""){exit(1);}

`/usr/bin/R CMD BATCH -q --no-save --slave --vanilla $ar $ar.tmp`;
$cattmp=`/bin/cat $ar.tmp`;
@cat=split(/\n/,$cattmp);
foreach $i (@cat){
if($i=~/During startup/){next;}
if($i=~/Setting LC_CTYPE failed/){next;}
if($i=~/proc/){last};
print "$i\n";
}

`/bin/rm $ar.tmp`;
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