crcdisk.sysでVista起動が止まる

質問

Vista sp2をセーフモードで起動するとcrcdisk.sysで処理が止まってしまいます。
状況を下記します。
お気づきのことありましたらよろしくお願いします。

０．システムコマンダー９
マルチOS利用のため、システムコマンダー９をインストールしていて、
VistaとXPの両方が使えます。

１．経緯
Excel2007を使用していて、書式コピーのボタンをクリックしたところ、ボタンが押し下げられた表示のままフリーズしました。しばらく待ってみましたが変化ないので仕方なくPCを強制終了し、再起動しました。
セーフモードで起動したところ、crcdisk.sysで処理がとまり数十分放置しても変化ありませんでした。

Google先生に聞いてみたところよくあるトラブルのようでいくつも検索されました。
http://pub.ne.jp/raku/?entry_id=2327494
↑の記事を参考に、
(1)再起動
(2)S-ATAケーブルの差し替え
(3)CMOSクリア
(4)BIOSの設定でS-ATAをIDEからAHCIに一度変更し起動したあとで
　再度IDEに戻して起動

(1)～(4)を２度試しましたが、状況は変わりませんでした。

そこでVistaのDVDからブートし、修復インストールを試みましたが、OSが表示されません。

強制終了し、いま一度VistaのDVDからブートし、スタートアップ修復を試みましたが、
数時間たっても終了しませんでした。

他のOSはどうかと思い、
システムコマンダーのOS選択画面でXPの起動を試みましたが、こちらも起動しませんでした。
強制終了し、セーフモードで起動したら、ドライバの読みこみは終了、
カーソルが表示され数十分後、エラー表示が出ました。
Correcting Error in index $I30 for file 62
Insufficient disk space to correction error
in index $130 of file 62

Correcting Error in index $I30 for file 215
Insufficient disk space to correction error
in index $130 of file 215
・
・
（以下、fileの次の数だけ違って繰り返し。
384, 516, 553, 2572）

さらに待つと、

Unspecified error ocurred

と表示され、
さらに待つと、ブルーバックスクリーンになって、

STOP:c000021a unknown Hard Error
Unknown Hard Error

と表示されました。

２．使用システム
CPU：AMD Athlon 64 X2 Dual-Core Processor 5600+
マザー：ASUS M2N-SLI Deluce
メモリ：DDR2 PC2-6400 CL5 1GB ×2枚
HDD:Hitachi HDT725032VLA360 300GB ×2台
*マザーの機能により、RAID 0を組んであります。

３．トラブル前のパーティション構成
基本：100GB　Vista
基本：40GB　XP
基本：20GB　空き
拡張/その１：200GB　データ
拡張/その２：140GB　データ
拡張/その３：100GB　データ
*サイズはうろ覚えなので確実ではありません。

以上です。とても困っています。
詳しい方、ぜひご教示よろしくお願いします。