Office2000とATOK14を使っています。オフィスＸＰわかりません。
＞「ツールバーにの右下にＩＭＥとＡＴＯＫ両方のアイコンがあります。」
このアイコンどんなアイコンですか？
ａ：IME2000（XP）＿赤い丸のマーク ｂ：ペンのマーク C：ATOKのマーク
ａとｂのアイコンであれば問題ないと思います。マウスをアイコンの処に持っていった時に「IME2000」と両方とも表示されます。
ａは現在使っている日本語入力の設定です。（ひらがな入力とか）
ｂは使用する日本語入力の切替です。（IME、ATOKの切替）
ａとｃの両方の表示は出ません。
オフィスＸＰでは表示がでるのかもしれません？
ただ「相性が悪くすぐ削除しました。」という所が気になります。日本語入力の使用の設定を再度確認してみてください。
またＩＭＥが完全に削除されていないのではないでしょうか。ＩＭＥだけを選択して削除されてみてはいかがでしょうか。
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