MySQLの挙動が変に・・・

質問

CentOS5.3を使用し、PHPのバージョンを4系から5.3へバージョンアップしたらMySQLの挙動が変になりました。

これまでは、
# mysql -u -p [enter]でパスワードを要求され、パスワード入力後MySQLにログインできていて、
mysql>show databases;を実行するとこれまでのデータベース一覧が当然出てきました。

バージョンアップ後、
# mysql -u -p [enter]でパスワード要求もなくログインされ、
mysql>show databases;を実行すると、
+--------------------+
| Database
+--------------------+
| information_schema
| test
+--------------------+
のみ表示されます。
どうしてこうなったのかわかりません。

PHPのバージョンアップは以下のとおりしました。
以前のPHPバージョンを削除
yum remove php php-*

5.3のインストール
# yum install php53 php53-mbstring php53-mysql

なお、WordPressをインストールした際にも以前は通常通りインストールできたのですが、
5.3にしてからは
「データベース接続確立エラー」と表示されDBへ接続できないようで困っています。

以前質問させていただいた時に
「MySqlの設定が初期化されたかMySqlも更新されたかです。」とご教授をいただいき、
# ls /etc/my.cnf*
を実行したところ、すでに
/etc/my.cnf
my.cnfが存在しております。

当該サーバーに以前より現存していたDBを使ったサイトの閲覧も可能なので、どうなっているのかわかりません。

緊急性を要し、再度ご質問させていただきました。

大変申し訳ございませんが、ご教授よろしくお願いします。