analog-sanのプロフィール

http://www.ir-share.com/2008/08/10/96 ここのサイトを見たところ、どうやら日経平均やTOPIXの数字と、 東証1部上場企業の単純株価平均というのには大きくずれがある (日経平均のピークは去年のサブプライムショックでライブドアショックの影響をあまり大きく受けていないように見えるが、 　単純株価平均を見るとライブドアショック以来大きく下げ続けている) のですが、 この違いはなぜ起こるのでしょうか？ この記事のGMOインターネットとの関連を見たところ、 単純平均株価を見たほうが参考になるように思えてしまったのですが、 市場の動きとしてどちらを参考に、どのように考えればいいのでしょうか？