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統計R：個体差を考慮した生存分析
stomachmanの回答
ANo.3へのコメントについてです。 > ということでしょうか・・・？ いや、そこまでキツいこと言ってる訳じゃないんですが、えーと、つまり…そういうことです。 いろんな検定法があるけど、それぞれ独自の「ある程度一般的・抽象的なある仮定(モデル)を含む帰無仮説と、そこから演繹される確率論的予言」、いわばテンプレートですが、これが前提になっています。そのテンプレートを理解しないままにただ検定法を使う、ということを指して「道具に振り回される」とANo.2で申し上げたのです。 たとえば、多数の個体について1回目のタイムと2回目のタイムの差を測ったら、概ね正規分布になったとしましょう。で、あるひとつの個体を取り上げて、「そいつは、他の個体に比べて、タイムの差が特別に大きいかったかどうか」ということを問うなら、得られた分布の平均と分散を基準にして検定すればいいだろう。この話がどういう検定法のテンプレートにマッチするかはもちろんお分かりでしょうし、帰無仮説を構成することも容易でしょう。 ご質問の場合は「2回目の方が1回目より速いかどうか」を問うようです。その際に、基準は一体何なのか。もう少し精密に言えば、どのようにして測った値(つまり、どんな確率変数)ならば、目的の検定に利用できるような（その確率変数の分布についての）何らかの予言が成立するだろうか。 それを検討する際には大抵の場合、「これはまあ、確かでしょ」と思われる仮定を前提に考察する。（なので、できあがった帰無仮説には、「これはまあ、確かでしょ」の部分も明示的に含んでおかなくちゃいけません。）そして、帰無仮説から検定に利用できる予言（命題：「もし帰無仮説が正しいなら、尺度○で測った確率変数は＃%の確率で△以下である」というような）を演繹する。 で、いざ検定をやろうという段階になってたまたま、おお、丁度この検討結果とマッチするテンプレートがあるぞ、ということなら、その検定法のプログラムが流用できる。そんなものがなければ自分で作る。（というのが本来のスジですが、実際には、あらかじめいろんなテンプレートに関する知識を利用して適切な検定法を決めた上で、実験をデザインするんです。ですがそれはさておき。） これがもし、肝心の検討の段階をすっとばして「トニカク手持ちの検定法プログラムセットの中からテキトーに選ぼう」というのだったら、ナニやってんだか分からん、ってことです。 指導者もいらっしゃるようですから、このあたり、じっくり議論なさってみると良いかと。 http://okwave.jp/qa/q4058851.html も多少はご参考になるやも
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