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パリンドローム(回文)構造
ゲノム中の回文配列についてはよく耳にします。制限酵素の認識配列は特に有名です。私も興味を持ってきました。しかし、その生成過程が分かりません。レトロポゾンなどの場合は平行移動だと思いますので、DNA→mRNA→逆転写→DNAへの挿入という過程で説明できるかと思うのですが、回文をこの過程で強引に説明しようとすると、もとの配列とその相補鎖が回文状につながるのみでうまく説明できません。 一体回文はどうやって作られたのでしょうか?配列上にもともとあった偶然の産物なのでしょうか?
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>それこそ、パリンドロームではないですか。 全くです、私は何を見ていたのでしょうか(笑)お恥ずかしい。ゲノムでの回文は相補鎖を介した構造でしたね。長い配列で、出現頻度がランダムな場合より高いものなどは、レトロポゾンの可能性がありますね。図もわかりやすく、参考になりました。回文‥パズルのようで私は好きです。ありがとうございまいた。