- ベストアンサー
あるバイオ系の論文の内容を教えてください。
この論文がおこなっているのはすべての動物に共通して存在するMTHFRとういう酵素にアミノ酸置換を行い、オーソログから酵素機能を評価、予測するものです。しかし、この実験で行っている手法やまたその手法の意義を読んでも分からず、困っています。どなたか教えてください。 http://www.plosgenetics.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pgen.1000968
- tattatatta
- お礼率36% (12/33)
- 生物学
- 回答数1
- ありがとう数4
- みんなの回答 （1）
- 専門家の回答
質問者が選んだベストアンサー
- ベストアンサー
直接的な回答にはなっていませんが、google翻訳を利用してみてください。 http://translate.google.co.jp/ また、オンラインの英和辞典、英英辞典のホームページも使ってみてください。 http://dictionary.goo.ne.jp/ej/ http://www.oxfordadvancedlearnersdictionary.com/ 日本語版、英語版のウィキペディアも参照してみてください。 http://www.wikipedia.org/ google翻訳を利用した所、全文こそ完全な日本文では表示されませんでしたがある程度意味は通っている気がします。不自然な日本文は原文を参照しながら逐一翻訳してみてください。 直接の回答でなく、ヒントですみませんでした。
関連するQ&A
- アミノ酸の疎水性と親水性を数値化
アミノ酸20種の疎水性＆親水性の傾向を表す数値などがあれば教えてください。 実験であるタンパク質の特定の残基のアミノ酸置換を行った変異体(たとえばある蛋白Met200残基をAlaやGlｙなどに置換しました変異体)を構築しました。 その変異体の活性測定を行い、置換後のアミノ酸の疎水性＆親水性と活性測定値の相関関係を得たいと考えています(たとえばM200A変異体のAlaの疎水性を数値化、M200G変異体のGlｙの親水性を数値化し活性測定値と比較して、アミノ酸の親水＆疎水性の強弱が活性値に影響するか検討したいのです)。そこでアミノ酸20種の疎水性＆親水性の傾向を表す数値などがあれば教えてください。hydropathy indexが使えると思ったのですが、これは二次構造予測などに使うとなっていたので、現在、私が行おうと思ってる、置換残基毎の活性値との相関関係を得るには適用できないと考えています。 教えていただいた数値をX軸、活性測定値をY軸として表を作成しようと考えています。
- ベストアンサー
- 化学
- 複数のタンパク質に共通する特徴の調査項目を教えてください
初めて質問させて頂きます。 私はこれまでタンパク質を扱ったことが無いため，タンパク質情報の一般的な調査方法を知りません。 現在のところ，数千のタンパク質群から，あるＰＣソフトによってある特徴を持つタンパク質を３０に絞りました。 これらについて，さらに共通する特徴を調べ，実験を組んでいこうと思っているところです。 現在，３０タンパク質に対して調べている調査項目は， １．NCBIで提供されている情報（MeSHなどで，もちろんPubMedから論文検索もしています） ２．プロモーターや転写因子 から共通点を探しています。 わずか３０タンパク質なので，一つ一つ調査しています。 そこで質問ですが，この他に共通点を探すための調査項目を教えて頂けないでしょうか（お時間があれば，調査手法も教えてください）？ よろしくお願いします。
- 締切済み
- 生物学
- 豆腐の消化吸収率は実は、とても悪いのでは？
豆腐ばかり食べると体重が減る。便が緩くなる。よく噛んで更に消化を良くしたとしてもです。 そもそも淡白質はアミノ酸に分解されても、そのアミノ酸の９０％は糖に変換されるのだから、豆腐を食べる事が体重が減る事に直結するというのはおかしいのではなかろうかと。 世の中的には、どういう実験を元にして、豆腐は消化に良い食べ物として評価されているのでしょうか？ 食べた豆腐の栄養素の量と、便の栄養素の量とを比較する手法が採用されているのでしょうか？ 、 便には豆腐の栄養が残ってないから、豆腐は吸収率が良いとか結論されているのなら、その評価は間違いだと思います。 なぜなら小腸にて豆腐が一切消化されなくても、大腸菌自身が豆腐を消化して吸収してる場合は、便に豆腐の栄養素はカケラも残らないからです。 本当に豆腐は消化に良いのでしょうか？ 個人的尺度だと、豆腐はスルメイカと同じくらい不消化物だと思う。
- 締切済み
- 栄養・サプリメント（健康）
- 人体組織と細胞の違い。
遺伝子およびタンパクの発現異常を調べる実験をしています。そこで私は人体の組織切片を用いて免疫染色などの手法を用いて調べているのですが、人体組織では細胞が既に死んでしまっているため、動的な解析が出来ません。細胞を用いた実験なら動的解析も可能と考えられるのですが・・・。 そもそも、人体組織は一度パラフィン包埋してしまえば保存が簡単などの利点もありますが、切り出した組織の個人差などで株化した細胞とは違い、同じ処理を行っても安定した結果が得られないように思います。また、網羅的に行った組織の免染の結果を性別、年齢、stageなどで分類することにどのような意義があるのでしょうか？ 遺伝子やタンパクの発現異常による病気の治療を考えた場合、その遺伝子またはタンパクが治療ターゲットとなりうるかを評価すれば良いのであるから、人体組織を使って疫学的な評価を出す必要はないと思うのですが、どうなのでしょうか？ 細胞を用いた実験よりも人体組織を用いた実験の方が優れている点とは一体どういったところなのでしょうか？ 以上の質問の答えを教えてください。出来れば分子生物学、医学の専門家にお答えいただきたいと思います。
- 締切済み
- 科学
- 生物系×論文書いてやる×博士号とってやる！応援希望！
こんちは！某大学の生物系分野の学生です。 個人を特定しやすい可能性があるのでテーマを間単に言うと、『分子細胞生物学、細胞内外シグナル伝達、細胞分化、極性、増殖、発生etc』といった感じです。 研究めっちゃ好きです！が、正直言って力不足です。ほんまに助けてください！さすがに博士を狙うからには全て自分でやっていかないといけへん事は分かってます。でも、指導放棄（修士入ったとき時からずっと…というより学部４年のときからでしょうか…汗）は流石に無しやと思うんです。ディスカッションくらいアグレッシブにいったっていいですよねえ？むしろ評価されるべきでしょう？正直言って、これまでは自分の力だけで乗り越えてきましたが、研究者としてのアタマは学部の学生とさほど変わらず（ある程度は上からの指導がないと越えられるものも越えられないと思います…）成長していないに等しいと思います。 意欲があるなら、そんな研究室はさっさとやめて他のラボへ行けと思われるかも知れませんが、経済的時間的余裕はありませんし、今の研究内容に愛着があります。どうしてもこのテーマで論文書いてみたいのです。長くなりましたが、以下に相談事を列記します。 (1)分子細胞生物学関係の研究をするにあたって参考に出来る書籍やホームページなど教えてください。駆け込み寺的な存在が欲しいです。 (2)研究実験一つ一つをやっていったりするにあたって、新しい内容（例えば、実験手法や注目する分子に関する知識・理解・念頭に置かないと）に出くわす事は日常茶飯事だと思いますが、この場合の参考方法、対処法など。 (3)生活術に関すること。 (4)それなりのジャーナル（JBCクラスはいきたいです）に出すに至るまでの筋道。 (5)そもそも論文の読み方からして微妙かもしれません。文献の検索の仕方も甘いかも… (6)研究・実験の戦術戦略の立て方について。 (7)優良関連サイト（ツールなど含む）、ブログ、BBSなどを教えていただきたい。 (8)そのほか気付かれた事や注意すべき事。（これまで全て独学でやってきたので自分の力だけで気付けないような事が一番重要かもしれませんが…） 一番よいのは（都合の良すぎる話ですが）人に教える事が割りと好きで何かにつけて相談できる人を見方につけることであるとは思うのですが、当ラボとつながりのあるところは……もしあったならこのサイトに来る前に相談してます（汗） 学内の他のラボの人は殆どが分野違いですし、そもそも進学者が皆無… 何か一つでもアドバイスをいただける事がございましたら、些細なことでも大歓迎です。よろしくおねがいします。
- 締切済み
- 大学院
- nature（論文）の和訳添削のお願い（その１０）
QNo.7312306の続きです．natureに掲載された論文の訳です．苦戦です．どなたか添削をお願いします． (1)It is also of interest that TERT (telomerase reverse transcriptase) showed stable expression regardless of age (Supplementary Fig. 12). (1)また，TERT（テロメラーゼ反転転写酵素）は，老化に関係なく安定発現を示したということは興味深い． (2)This finding is consistent with the role of the telomerase complex, highlighted by positive selection on TEP1 and TERF1. (2)この発見はテロメラーゼ複合体の役割であるが，（そしてそれは）TEP1およびTERFの正の選択が浮き彫りにしたことと一致する． (3)Overall, transcriptome and sequence data revealed different (compared to humans, mice and rats) patterns of NMR genes, which may underlie longevity mechanisms in this animal. (3)全般的に言えば，トランスクリプトーム（≒全体像を定量的あるいは定性的に把握する研究手法）および 配列データは（ヒト，マウスおよびラットと比較した）差異を明らかにした．そしてそれは，この動物（この論文の流れよりハダカデバネズミ）の並外れた長寿根拠となるといっても差し支えない． （自然な訳）全般的には，トランスクリプトームおよび配列データは，ヒト，マウスおよびラットと比較した差異を明らかにしたが，このことが，この動物（この論文の流れよりハダカデバネズミ）の並外れた長寿の根拠といっても差し支えない． (4)Non-shivering thermogenesis is a major heat production process in mammals that mainly depends on the action of UCP1, one of the 39 vertebrate genes that changed uniquely in the NMR (Supplementary Table 19). (4)非ふるえ熱産生は，ＮＭＲの他に類を見ない変化を遂げたｕｃｐ１（３９種の脊椎動物の遺伝子の１つ）の中心的な作用に主に基づく哺乳類の熱産生工程である． （意味）ＮＭＲのｕｃｐｌ（脊椎動物の３９種類の遺伝子の１つ）は他の哺乳類には見られない変化を遂げたものであるが，ＮＭＲの熱産生工程はこの作用による非ふるえ熱産生である． (5)UCP1 featured changes in amino acids Gln 146, Arg 263,Trp 264 and Thr 303, with the latter two residues being subject to positive selection (P,0.05, likelihood ratio test for the branch-site model, n530) and Arg 263 and Trp 264 located in the conserved nucleotide binding motif (Fig. 3a). (5)UCP１は，後者２つ（Trp264およびThr303）の残基の存在するポジティブ選択に依存するGLｎ146，Arg263，Trp264およびThr303のアミノ酸の著しい変化を特徴とする． ←自信なし (6)With Arg–Trp instead of the rigid Gly–Pro in the key regulatory site, UCP1 is expected to lose the tight regulation by purine nucleotides as inhibitors and fatty acids as activators (Fig. 3b and c). (6)重要な調節部位中の剛性Gly-Proがあり，UCP1（脱共役タンパク質／遺伝子）は，制御因子としてのプリンヌクレオチド，および活性化因子としての脂肪酸により厳密な(発現)調節を減少させると期待される (7)The same loop also features two positively charged Lys residues followed by a negatively charged residue (also a unique combination), that should markedly affect the local electrostatic potential of UCP1. (7)また，同じループ特性の２つの肯定的に変化したLys残基は，その後に残基の消極的な変化が続く（また，固有の組合せでもある）．（そして）それは、著しくUCP1のローカルの静電ポテンシャルに影響するに違いない。
- ベストアンサー
- 英語
- nature（論文）の和訳添削のお願い（その９）
QNo.7312306の続きです．natureに掲載された論文の訳です．苦戦です．どなたか添削をお願いします． (1)It is also of interest that TERT (telomerase reverse transcriptase) showed stable expression regardless of age (Supplementary Fig. 12). (1)また，TERT（テロメラーゼ反転転写酵素）は，老化に関係なく安定発現を示したということは興味深い． (2)This finding is consistent with the role of the telomerase complex, highlighted by positive selection on TEP1 and TERF1. (2)この発見はテロメラーゼ複合体の役割であるが，（そしてそれは）TEP1およびTERFの正の選択が浮き彫りにしたことと一致する． (3)Overall, transcriptome and sequence data revealed different (compared to humans, mice and rats) patterns of NMR genes, which may underlie longevity mechanisms in this animal. (3)全般的に言えば，トランスクリプトーム（≒全体像を定量的あるいは定性的に把握する研究手法）および 配列データは（ヒト，マウスおよびラットと比較した）差異を明らかにした．そしてそれは，この動物（この論文の流れよりハダカデバネズミ）の並外れた長寿根拠となるといっても差し支えない． （自然な訳）全般的には，トランスクリプトームおよび配列データは，ヒト，マウスおよびラットと比較した差異を明らかにしたが，このことが，この動物（この論文の流れよりハダカデバネズミ）の並外れた長寿の根拠といっても差し支えない． (4)Non-shivering thermogenesis is a major heat production process in mammals that mainly depends on the action of UCP1, one of the 39 vertebrate genes that changed uniquely in the NMR (Supplementary Table 19). (4)非ふるえ熱産生は，ＮＭＲの他に類を見ない変化を遂げたｕｃｐ１（３９種の脊椎動物の遺伝子の１つ）の中心的な作用に主に基づく哺乳類の熱産生工程である． （意味）ＮＭＲのｕｃｐｌ（脊椎動物の３９種類の遺伝子の１つ）は他の哺乳類には見られない変化を遂げたものであるが，ＮＭＲの熱産生工程はこの作用による非ふるえ熱産生である． (5)UCP1 featured changes in amino acids Gln 146, Arg 263,Trp 264 and Thr 303, with the latter two residues being subject to positive selection (P,0.05, likelihood ratio test for the branch-site model, n530) and Arg 263 and Trp 264 located in the conserved nucleotide binding motif (Fig. 3a). (5)UCP１は，後者２つ（Trp264およびThr303）の残基の存在するポジティブ選択に依存するGLｎ146，Arg263，Trp264およびThr303のアミノ酸の著しい変化を特徴とする． ←自信なし (6)With Arg–Trp instead of the rigid Gly–Pro in the key regulatory site, UCP1 is expected to lose the tight regulation by purine nucleotides as inhibitors and fatty acids as activators (Fig. 3b and c). (6)重要な調節部位中の剛性Gly-Proがあり，UCP1（脱共役タンパク質／遺伝子）は，制御因子としてのプリンヌクレオチド，および活性化因子としての脂肪酸により厳密な(発現)調節を減少させると期待される (7)The same loop also features two positively charged Lys residues followed by a negatively charged residue (also a unique combination), that should markedly affect the local electrostatic potential of UCP1. (7)また，同じループ特性の２つの肯定的に変化したLys残基は，その後に残基の消極的な変化が続く（また，固有の組合せでもある）．（そして）それは、著しくUCP1のローカルの静電ポテンシャルに影響するに違いない。
- ベストアンサー
- 英語
- 「酸、アルカリによる男女産み分け法」という民間療法について
最近、インターネット上や一部の産婦人科医で「酸、アルカリによる男女産み分け法」という物が流行っているそうです。 私は発生学（動物発生工学）や遺伝子工学について学んで来た事もあり、そのような民間療法は全く信じていません。 発生学を専門としている大学の教授も、この民間療法には否定的な考えを持っているようです。 （なお、学術書では「動物発生工学（朝倉書店,2002）」が「何ら科学的根拠はない」と否定的な記述をしています） 実際、家畜生産の分野では雄、雌を産み分ける事ができれば様々なメリットがあるそうで、最近では遺伝子工学を用いた手法まで研究している方もいらっしゃるそうです。 ホントに酸、アルカリで産み分けができるのなら、発生学者さんや家畜生産者さんに取っては朗報だと思います。 最近では産み分けができると噂される健康食品まであるそうです。 もし本当に酸、アルカリで片性の精子が淘汰出来るのなら動物実験や試験管内実験で簡単に再現できると思います。 民間療法的な本や雑誌ではなく、データーが報告されている学術論文などありましたら教えて頂ければ嬉しいです。
- 締切済み
- 生物学
- 論文の内容
高1です。学校の授業で、論文をかくことになりましたが、 思いつきません。 テーマは「お茶」です。 どんな流れとか教えてください。 できるだけ、具体的に
- ベストアンサー
- 日本語・現代文・国語
お礼
ありがとうございます。