- 締切済み
★マイクロサテライトのアレルサイズの疑問★
大変困っておりますので、皆様、ご教示のほど、宜しくお願いします↓ 大学の実習でマイクロサテライト（SSR）を使った実験を何度か続けてきました。ABIシーケンサーでジェノタイピングをするのですが、その際にアレルと思われるピークの出てくるサイズが２bpごとに綺麗に出るものがある一方で、所々1bpしか間隔を置かないで、次のアレルが出現する遺伝子座（マーカー）もあります。 マイクロサテライトはいわゆる「反復配列」ですので、普通は2bpごととか、3bpごととか、ある一定の間隔を持った周期性のあるアレルの出現が期待できそうですが、このように不規則な間隔を持って（例えば、サイズ100、102、104、105、107、108、110、113、114…といった位置にアレルが出てくる）出現するのは、どうしてでしょうか（こういうマーカーでも再現性はあるみたいですが）？ そしてこういうマーカーを使って研究を進めても特に問題は無いでしょうか？ 分からない事だらけなので、是非お教え頂けないでしょうか？
- みんなの回答 （1）
- 専門家の回答
みんなの回答
- ga111
- ベストアンサー率26% (247/916)
関連するQ&A
- ★マイクロサテライトのアレルサイズの疑問★＜再質問＞
大変困っておりますので、皆様、ご教示のほど、宜しくお願いします↓ 大学の実習でマイクロサテライト（SSR）を使った実験を何度か続けてきました。２bp（例えばACACAC…とか）のある配列の反復…と原著論文には書かれているマーカーで、ABIシーケンサーでジェノタイピングをするのですが、その際にアレルと思われるピークの出てくるサイズが２bpごとに綺麗に出るものがある一方で、所々1bpしか間隔を置かないで、次のアレルが出現する遺伝子座（マーカー）もあります。 マイクロサテライトはいわゆる「反復配列」ですので、普通は2bpごととか、3bpごととか、ある一定の間隔を持った周期性のあるアレルの出現が期待できそうですが、このように不規則な間隔を持って（例えば、サイズ100、102、104、105、107、108、110、113、114…といった位置にアレルが出てくる）出現するのは、どうしてでしょうか（こういうマーカーでも再現性はあるみたいですが）？ そしてこういうマーカーを使って研究を進めても特に問題は無いでしょうか？分からない事だらけなので、是非お教え頂けないでしょうか？ ※以前、同内容に質問をしたものの、殆ど回答が得られなかったため、 再質問とさせていただくものです
- 締切済み
- 生物学
- DNA抽出
マイクロサテライトマーカーを用いたPCR法で２種類のイネのDNAバンドサイズを測定しました。２種類を６つずつ、全部で１２サンプルのバンドサイズを測定しました。しかし、１２サンプルの内の２サンプルだけ、バンドが現れませんでした。１２サンプル同時に作製したので、手順の間違いは無かったと思うのですが…。。。 しかし、サンプルがでなかったのですから、なんらかの失敗があったことはまちがいないのです。 もしかしたら、DNA抽出時に２種類のサンプルがコンタミしてしまったのか、と考えたのですが…。自信も根拠もありません。 どのあたりで失敗したのか、 見当がつく方、どうか助言していただきたいです。
- ベストアンサー
- 生物学
- マイクロサテライトについて
マイクロサテライトとは同じ繰り返しの非コードの部分で、個人を特定するのに使われているのと考えて良いのでしょうか？もちろんそれだけのためにあるのではないと思いますが。それに関連してハンチントン病もＣＡＧの繰り返しが多すぎて疾患を起こすみたいな記述を。。。マイクロサテライトとハンチントンの関連性を教えてください
- ベストアンサー
- 生物学
- 研究におけるアレルの意義
現在アレル(対立遺伝子)について勉強しています。 様々な文献や教科書を読んでいて理解も深まってきたところなのです。しかし、アレルの生物学の研究上においての意義・重要性といった観点からの見解がいまいち不明瞭であります。自分なりに色々と考えたのですが、明確な答えが見つかりません。 どなたかアレルの重要性についてお答えできる方いらっしゃいませんでしょうか？
- ベストアンサー
- 生物学
- サテライトサイトが開けません
例えば http://www.nhk.or.jp/asadora/cast/cast.html 上記サイトまでは問題なく開けますが、登場人物個々の詳細サイトが開きかけてすぐ閉じてしまいます。 解決方法はあるのでしょうか？
- 締切済み
- その他（インターネット・Webサービス）
- サテライトマネージャについて
無線LANの設定について質問です。らくらく無線設定で設定しようとしたのですが、どうしても設定を完了することが出来ず、マニュアルを見ながらチマチマやってたら何故かネットに接続は出来てしまいました。でもサテライトマネージャのプロパティのネットワーク一覧を見ると登録が完了しているとチャネルの欄の左隣に本来は「済」という文字が入るようなのですが入ってません。また同じくネットワーク一覧のタブで一番左側にチェックの絵が入るのが正解のようですが、親機と子機が通信してるような(?)絵が描いてあります。ネットには繋がっているのですが多分何か設定が洩れているのか、よく分からないのですが恐らくダメな状態なのだと思います。登録済にするにはどうしたらよいのでしょうか？下手な説明で申し訳ないのですがよろしくお願いします。モデムはNEC AtermWD701CVで子機はAtermWL54SU2です。
- ベストアンサー
- Wi-Fi・無線LAN
補足
早速のご指摘、ありがとうございます。マーカーを開発した原著論文によれば（プライマーノート）、２bp（例えばACACAC…とか）のある配列の反復…とあるのですが。。それでもところどころ1bpの間隔しか無いアレル出現が認められ、困っています。