初めて系統樹の勉強をしているのですが、系統樹の作成をするとき、十分な解析を行わなければならないとは思いますが、どのような点に特に気をつければいいのでしょうか。また、近縁な関係にあることがわかっているのに、系統樹を作成すると、結果では近縁ではないように思えるのですが、どのように考えればいいのでしょうか。使用する配列にも問題はあるかと思いますが、なにぶん系統樹の作成、おもしろそう程度の知識ですので、よろしくお願いいたします。
投稿日時 - 2007-10-25 10:06:05
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回答（2件中 1～2件目)
生物に必須な、ATPaseのコーディングリージョンやイントロンの塩基配列や、r（リボゾーマル）DNAの配列を複数比較するのが良いでしょう。
系統樹の作成方法は、複数の論文に載っているので、プログラムもあると思います。
必須ではない酵素の塩基配列だと、変異が多過ぎて近縁関係が分かりません。
投稿日時 - 2007-10-26 16:28:32
補足
ありがとうございます。
進化の本に出てくるような動物の系統樹を作ってみたいと思っているのですが、何か良い方法はないでしょうか？良い方法があれば教えてください。よろしくお願いします。
投稿日時 - 2007-10-26 17:29:30
