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転写について教えてください
転写について全くの素人なので、よろしくお願いいたします。 プロモーターのSP1結合モチーフを調べていたのですが、 論文によりますとSP1結合モチーフとされている配列は多くのパターンがあるようで（CCGCCTやGGGCAGなど、誤解だったら申し訳ありません）、SP1認識配列とは一体どんな配列をいうのか混乱してしまいました。 １．転写因子SP1を認識するDNAモチーフにはどんな配列があるのでしょうか？ ２．プロモーターの特異性を残したままプロモーター活性を増強する場合には、そのプロモーターに固有に存在するSP1認識配列を用いた方がよいのでしょうか？ ご教授いただければと思います。よろしくお願いいたします。
- lyzly
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- MIYD
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1 色々。 2 ケースバイケース。 SP1認識サイトががそのプロモーターの特異性に関与しているかを事前に知ることはまず無理です 元の配列を変えるのであれば、それなりの説明とデータが必要です
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お礼
1．確かに色々あるようですね。DNAモチーフ検索でGRGGCRGGGWやNGGGGGCGGGGYNというパターンが出てきましたので、とりあえずこんな形のものをSP1というのだろうと思う事にしました（他にも色々パターンがあるのかもしれませんが）。 2ですが、プロモーターの特異性を残したままプロモーター活性を上げる方法を模索しております。何かご存知でしたらご教授いただければと存じます。無理だったらCMVのminimalプロモーターを下流に繋げて増強するかSP1認識配列を挿入したらどうかと言われたのですが、これでは特異性はどうなるのだろうと疑問に思っているところです。 早速のご回答ありがとうございました。