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PCR法とそれを用いた分子系統樹について
miedaiの回答
- miedai
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質問が漠然としていますから、前の回答者以外の情報を入れておきます。あなたがこの分野についてあまり知らないと仮定します。 ＰＣＲは、ＤＮＡの特定の部分を指数関数的に増幅するための手段です。ごくわずかなサンプルからもターゲットとするＤＮＡ断片を大量に得ることができます。これを解析に使うわけです。 分子系統樹を作るときには、得られたＤＮＡ断片の塩基配列をまず決定することが多いのです。系統樹を作る以上、いくつかの生物について塩基配列を決定していなければなりません。これらを比較すると、同じところと異なるところがあります。例えば、一つがAATGで、もう一つがATTGだったりする（本当は、塩基の数は1000にも達することが多いのです）。この場合、前者と後者では一つだけ塩基が入れ替わっています。 このような塩基配列の違いをもとに、生物間の系統関係を推定します。得られた配列の違いを生じさせるためにどれだけの突然変異を必要とするのか、その最小数を計算して「生物間の近さ」を求めるのが節約法、類似度を計算して「近さ」を求めるのが「距離法」です。これ以外に最ゆう法という方法もあります。これらの方法論に関しては日本人の開発した方法が世界のスタンダードになっていることが多々あります。
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お礼
ものすごくよく分かりました。ありがとうございました。