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SNPについてお願いします。

だれもわからないみたいなので、もう一度質問します。 OK遺伝子rs3000のA群はC,C（n=8)、B群はC,T/T,T (n=14)の2群では A群はC,C（n=8)がB群はC,T/T,T (n=14）より有効性が高かった。 rs3000はスニップのリファレンス番号だとわかるのですが、この番号には C,CやC,T/T,Tがあるのですか？ よくわかりませんので、教えていただければと思います。 OK遺伝子rs3000のハプロタイプでrs3000はいろいろな変異領域を含んでいるということなので しょうか？

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noname#250373
noname#250373
回答No.1

>OK遺伝子rs3000のハプロタイプでrs3000はいろいろな変異領域を含んでいるということなので しょうか？ ここで見ているのはrs3000という１つの変異領域です。 >rs3000はスニップのリファレンス番号だとわかるのですが、この番号には C,CやC,T/T,Tがあるのですか？ 実際にNCBIのdbSNPで検索すれば分かります。 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp 実際のrs3000は以下のような表記になっています。 AAGCACAGAGGAACAGCCAAGAGAT[C/T]TTACCGTGGTCTTACTAAAGTACAT これは左右の配列に挟まれた特定の場所がCまたはTのSNPをもつという意味です。 ヒトは相同染色体をもっているので、該当する場所が２つあることになります。 両方の相同染色体がCの人もいれば、C,T両方もつ人も両方Tの人もいる訳です。 お分かり頂けたでしょうか？ P.S. 同じ質問を閉め切らずに複数投稿するのは禁止ですので、以前の質問は消した方が良いですよ。

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