- ベストアンサー
転写因子の探索方法について教えて下さい。
- みんなの回答 (1)
- 専門家の回答
質問者が選んだベストアンサー
包括的にならば、 その配列でアフィニティーカラムを作って、釣ってきて、 (2Dか)SDS-PAGE後にLC-MS/MSはいかがでしょうか
関連するQ&A
- 転写因子の結合部位について
転写因子.(transcript factor binding site) の結合部位について教えてください.(私は素人同然です.) 1.転写因子が結合する部位というのは,DNA上のどの場所でも結合するのでしょうか? 2.ある遺伝子のプロモータ領域に結合すると,後方の遺伝子の転写を制御するのでしょうか?
- ベストアンサー
- 生物学
- 遺伝子のプロモーターの転写因子結合サイトの検索方法
ある遺伝子がどのような転写因子によって制御されているか知りたいのですが、遺伝子の名前だけで制御に関与する転写因子を予測してくれるようなサイトはあるのでしょうか? あるいは、ある遺伝子のプロモータ領域の塩基配列を調べて、TESSなどの予測サイトで検索する方法を取る場合、どのようにしてプロモータ領域の塩基配列を入手すればよいのでしょうか? よろしくお願いいたします。
- 締切済み
- 生物学
- 転写因子の結語配列の検索
生物学の学生です。転写因子の結合配列を検索する便利なサイトやソフトがあれば教えていただけないでしょうか?たとえば、数キロbpの配列をペーストするとそこにある転写因子の認識配列の候補を教えてくれる、などです。また、ランダムな配列(たとえばTTCCCAなど)があるかどうかを検索できるソフトやサイトをご存知でしたら教えていただけないでしょうか?初心者なので基本的な質問で申し訳ありません。(もしかしてGENETYXなどでできますか?)
- ベストアンサー
- 生物学
- ZingFinger、GATA型転写因子、について
生物好きの素人です。生物(遺伝学)の本を読んでいて、しばしば出てくるのに今ひとつ理解できないのが、Zing Fingerです。同じくGATA型転写因子という言葉もしばしば出てきます。 大変勝手なお願いですが、わかりやすく教えてくださったら大変嬉しいです。または高等学校の生物くらいの知識の私で理解できるくらいわかりやすく説明されているサイトは無いでしょうか。 よろしくお願いいたします。
- ベストアンサー
- 生物学
- 脂溶性ホルモンと核内受容体の複合体が成す転写活性について
ホルモン(特に甲状腺ホルモン)が核内の受容体と結合し,特定の遺伝子の転写を活性化する際についての質問です. 転写活性が終わったあと,ホルモンとレセプタが結合したコンプレックスはどうなるんでしょうか? (1)HREと結合したまま. (2)HREから離れ,他の遺伝子の転写に再利用される. (3)HREから離れ,他の物質によって壊される. (4)HREから離れ,コンプレックスも解かれそれぞれ基の物質へと戻る 専門知識がないため,専門用語など間違っているかもしれません.分かる方どうかよろしくお願いいたします.
- 締切済み
- 生物学
- GAL4-UASについて
哺乳類細胞を用いたレポーターアッセイで、GAL4-UASの下流にルシフェラーゼなどを組み込んだ実験系を目にしますが、哺乳類細胞に内在する他の転写因子がUASに結合することによってレポーター遺伝子が動いてしまい、結果として擬陽性になるというようなことはないのでしょうか? イーストツーハブリッドの場合は転写因子のスクリーニングをかけようとすると擬陽性が出やすいと聞いているのですが・・・。
- 締切済み
- 生物学
- 転写についての範囲の問題についてヒントください!
大学3回の生物学科の者です。 遺伝学の過去問を解いていると、説明していない上教科書に載っていないことを穴埋め問題にして出しており、一部わからないところがありました。 エッセンシャル細胞生物学2版やセル4版を見ましたがそれらしい用語はありませんでした。 もし、答えがわかる方がおられましたら答えとなる用語と参考文献を教えれいただけないでしょうか? 詳細については用語さえわかれば調べられるので割愛していただいて大丈夫です。 また、わかるものだけアドバイスをいただけたので十分です。 もしお時間がありましたらぜひよろしくお願いしますm(_ _)m 【問題】 (1)遺伝情報が二本鎖のどちらかに含まれているかは遺伝子ごとに異なる。遺伝情報を含む鎖を( 空欄 )鎖といい、またその相補的な鎖は( 空欄 )鎖という。 [自分なりの考え] はじめは鋳型鎖と相補鎖かな?と思ったのですが、なんか違和感があるのでアドバイスお願いします。 (2)遺伝子Aの上流、または下流の離れた位置にあるシスエレメント( 空欄 )に結合した転写制御因子は、基本転写因子複合体と直接に、またはほかのタンパク質を解して間接的に相互作用し、遺伝子Aの転写を増幅または抑制する。 [自分なりの考え] たぶん物自体はエンハンサーとかプロモーターとかTATAboxのことだと思うんですけど、空欄に何を埋めればいいかわかりません。シスエレメントでひとつの言葉なのであえて入れるなら”配列”なのかな?と思うのですがいかがでしょうか? (3)ある代謝経路に必須の酵素Aの一方の対立遺伝子が変異し遺伝産物が欠損していて、もう一方の正常型対立遺伝子が発現するため、固体としては代謝異常を示さない。この遺伝様式の名称は何か? [自分なりの考え] 明らかに機能喪失型突然変異だとわかるのですが、答えが遺伝様式となっているので機能喪失型突然変異だとおかしいのかなという気がします。なので、機能喪失型突然変異は劣性遺伝の様式のことが多いので劣性遺伝が答えなのかなと考えたわけなのですが、これも漠然としすぎた用語なので疑問が残ります。アドバイスをお聞かせください。 【追伸】 この問題作った先生はあまり研究してない先生で、ほかの教授からもえせ教授と言われています^^;(5年以上研究してないそうです) なので、問題文がもともと不適切という可能性は十分ありま・・・・。 (一応教科書知識はあるとは思うのですが・・・)
- ベストアンサー
- 生物学
お礼
包括的にやるのに教えていただいた方法は良さそうですね。 今日指導教官に相談した所、教えていただいた方法をやらせてもらえるという事なのでやってみます。 ありがとうございました。