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膜貫通ドメインの検索
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http://au.expasy.org/tools/ からリンクの張られているサイトをあげときます。 私はTopPred（Mac版）をずっと使っていました。 こういうのは、パラメータ次第で判定が変わってくるので、ソフトの違いだけで異なる結果がでるというわけでもないと思いますが。 http://www.sbc.su.se/~miklos/DAS/ http://cubic.bioc.columbia.edu/predictprotein/ http://bioinfo.limbo.ifm.liu.se/tmap/ http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0/ http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html http://bioweb.pasteur.fr/seqanal/interfaces/toppred.html http://sosui.proteome.bio.tuat.ac.jp/sosuiframe0.html
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- shimuraushiro
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私SOSUIというのを使っています。これもSMART同様 に正確に出ないケースもありますが、ご参考まで。
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