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初歩的な質問ですいません。 PCRをしています。PCR産物を電気泳動すると、複数のバンドがでます。なぜでしょうか？ たとえば、100、200、300塩基の長さのバンドがでるとすると、これらはすべて、用いたプライマーによって増幅されたものなのでしょうか？それとも、プライマーの配列と完全に一致しなくても、このようなバンドがでるのでしょうか？
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PCRのことについて質問なのですが、現在私が行っている細胞から、DNAを抽出しPCRを行うという実験で、うまくいかず行き詰っているので質問させていただきます。 現在以下の条件でPCRを行っているのですが、うまくいきません。 組成 forwardプライマー：1μL（=1pmol/μL） reverseプライマー：1μL（=1pmol/μL） Go Taq 5xBuffer：10μL dNTP：5μL(final濃度で200μM) Go Taq DNA polymerase：1μL 鋳型DNA：1μL MgCl2：3μL 滅菌水：28μL 計50μL 反応 ・反応 96℃：5分 ↓ 25サイクル 96℃：1分 55℃：1分 72℃：1分 ↓ 72℃：5分 ↓ 4℃： 設計ではPCR産物の長さは約100塩基ですが、これを行うと50塩基のPCR産物が検出され、100塩基のものはまったく確認することができませんでした。 また、プライマーの長さは約20塩基です。プライマーのTm設定はアニーリング温度を55℃と設定して、それよりも+5℃のTm値を持つよう設計しました。 同様の質問をyahoo知恵袋でも行いまして、回答してくださった皆様の条件でも行いましたが、いずれも同じ結果となってしまいました。 http://detail.chiebukuro.yahoo.co.jp/qa/question_detail/q1449649784 また、最近sigma社のXNATR REDExtract-N-AmpTM Tissue PCR Kitの組成液にプライマーと細胞抽出液を入れてPCRを行いましたが同じ結果でした。 原因、改良点の指摘がありましたら是非教えていだけますでしょうか？
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回答していただき、ありがとうございました。