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２０年以上の夫婦で土地建物を譲渡
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＞２０年以上の夫婦は土地建物を２０００万まで譲渡… 譲渡でなく、「贈与」です。 有償譲渡なら、年数にも金額にも制限はありません。 http://www.nta.go.jp/taxanswer/zoyo/4452.htm ＞土地建物価格が５０００万のうち２０００… 贈与税や相続税での価格評価 http://www.nta.go.jp/taxanswer/sozoku/4602.htm と ＞売るとなったときの土地建物の価値が２０００万… “時価”とは違い、土地と建物とが税法の評価方法と同じ割合で増減するわけではありませんので、 ＞どちらでもないのか… ということになります。 百歩譲って、何年かあとの売値が、贈与時点での税法評価割合と完全に比例していたと仮定するなら、 ＞夫１２００万（６０％）妻８００万（４０％… です。 税金について詳しくは、国税庁の『タックスアンサー』をどうぞ。 http://www.nta.go.jp/taxanswer/index2.htm
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この場合、資産区分つまり「土地」「建物」にわけて、それぞれ共有持ち分割合をさだめる のが一般的だと存じます。 すなわち、土地・建物、それぞれ６０％と４０％に分けるのなら 実際そういう形で持ち分の登記がなされますから 売る時点でも夫１２００万（６０％）妻８００万（４０％） ということになります。
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