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蛋白質サイズ
ryumuの回答
結晶構造が報告されているのなら、masa1000rxさんのいうように直接測ってみたらいいでしょう。 ちなみに、RasMolのコマンドラインで”set picking distance”と打ち込めば、クリックした原子間の距離が分かります。 ただし、zarastro21さんがおっしゃるように、由来によって分子量が異なりますし、またフォールディング状態にも大きさは依存します。しかも、分子自体も揺らいでいるので(すなわち温度にも依存する)、分かるのはあくまで目安の大きさであることを忘れないで下さい。 実際の活性状態では、さらに形が変化することもあり得ます。
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お礼
大変参考になりました、有難うございます。 私の目的が界面に蛋白質が飽和吸着したときに何分子着くかが知りたかったので、ryumuさんの方法で十分な情報を得ることができました。