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cpコマンドのオプションについて
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参考URLにmanページの日本語訳があります。 ディストリによっては、端末でman cpとしても、同じものが得られるかもしれません。詳しくはmanページを見ていただけばいいですが、 -r は参考ページの通り仕様が確定していませんので、 >-rは使うなと書いてあるサイトもありました というアドバイスも出てくるのでしょう。-aはたぶんアーカイブの略だと思うので、通常のバックアップで使うのに最適でしょう。 ミラーリングを行うなら-fオプションですが、これも使い方を誤ると大事なファイルを失う可能性があります。
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>-r は参考ページの通り仕様が確定していませんので、 仕様が不確定なのですね。ご教授の通り、-aを使うようにします。 また、参考URLも載せて頂き、ありがとうございました。