• ベストアンサー

imageJによる画像スタッキングの問題

imageJで,100枚程度のtiff画像(X線CTによるスライス画像)をスタッキングしようとした際,その順番が若干おかしくなります. こういう順序はどのように決まっているのでしょうか?また,順番を変えるにはどうしたらよいのでしょうか? ご助言いただければ幸いです.

質問者が選んだベストアンサー

  • ベストアンサー
  • SortaNerd
  • ベストアンサー率43% (1185/2748)
回答No.1

情報が少ないので合っているか分かりませんが、ファイルの順番が狂う状況の1つに次のようなものがあります。 ファイル名に連番を付ける file1 file2 file3 file4 ... file10 file11 file12 ... file100 辞書式順序に並べる file1 file10 file100 file11 ...file19 file2 file20 file21 ... file99 WindowsXP(と多分Vistaも)のエクスプローラでは連番を認識して数の順に並べてくれるのですが、普通のソフトはそこまでやってくれないことがほとんどです。 これを防ぐためには連番の頭を0を埋めて桁数を揃えることです。 file001 file002 file003 ... file100 のように。 大抵のリネームソフトでリネーム可能です。

Uejiya
質問者

お礼

ご回答ありがとうございます. XPを使っているのですが,たしかにエクスプローラで見た場合きちんとした順番になっているのに何故?という気でおりました. 確認してみます.

関連するQ&A

  • ImageJで8bitのTIFF画像を開きたい。

    こんにちは。 いつもお世話になっています。 早速ですが、 フリーソフトのImageJで8bitのTIFF画像を開きたいです。 16bitのTIFF画像は問題なく開けますが、8bitだと圧縮したTIFF画像は開けませんのようなコメントがでます。 どうにかする方法はないでしょうか? よろしくお願いします!

  • imageJを用いたSTEM画像の抽出・結合について助けてください><

    imageJを用いてSTEM-EELSの、二つの異なる3次元スペクトルデータのイメージファイルを結合したいと思っています。 例えばスライス枚数が100枚のものと50枚のものをくっつけて、 スライス枚数が150枚のものを作りたいといった感じです。 このような画像の結合は可能なのでしょうか?? 自分の拙い文章の上、可能かどうかもわからないので、もしご存知の方がいらっしゃいましたらご教授ください。

  • ImageJで画像の平均値の明るさを比較しようとしています。

    ImageJで画像の平均値の明るさを比較しようとしています。 AnalyzeのMeasureコマンドで出た数値のMeanがその画像の明るさの平均値で良いですよね? 試しにカメラであるシャッタースピードの画像と、そのシャッタースピードを倍にした画像をそれぞれ作り比較しました シャッタースピードが倍と言うことは明るさが半分、つまりそれぞれの画像の明るさの比は2:1となるはずです。 しかしImageJのAnalyzeのMeasureコマンドで出たMeanの数値は2枚が1.5:1になりました。 これは2枚の画像での比較ですが、 同じことが1枚の画像の上でも起こっていると考えられます、 つまり、平均値を出す際 例えば明るさが1のピクセルと明るさが2のピクセルの平均が(1+2)/2=1.5とならずに(1+1.5)2=1.25となります。 この差をImageJのコマンドで補正する事はできないでしょうか? 試しにProcess-Math-Multiplyで1.5倍と2倍の差の1.33をかけてからMeanを出してみましたが 画像の明るさ全体が1.33倍に底上げされてしまい明るさの比率を変えることは出来ませんでした。

  • 医療画像について

    CT画像などの再構成間隔とスライス間隔の違いについてですが スライス間隔は画像と画像の幅厚というのはわかりますが、 再構成間隔といったものはどう違うのですか。 できるだけ詳しくお願いします。

  • ImageJの使い方についてお教え下さい

    ImageJを使ってフィルム上のウェスタンブロットのバンドを定量解析する際のご質問です(2つございます)。添付画像の上の写真のようなバンドを解析しておりますが、バンドが太く、隣のバンドとくっついています。 自分のいつものやり方では、細長い四角形で一番左側を囲んで、Analyze→Gels→Select First Laneで確定した後、隣のレーンにずらしてSelect Next Laneで確定し、すべてを確定した後、Prot Laneで表示し、出てきた山の底辺と思われるところに線を引いて、魔法の杖で山の面積を数値化したものをバンドの定量値としております。その際、図のようにバンドが隣と重なり、更にレーンの幅が異なる場合、最初に確定した四角形を隣にずらしただけでは、別のレーンのバンドにも四角形がはみ出るため、正確に数値化できません。(1)途中で四角形の幅を変更することもできないようですが、このような場合にはどのように調整をしたら宜しいでしょうか?(2)また左から5番目のように非特異なバンドが解析対象バンドのすぐそばにある場合、添付画像の下の図の通り、どこが底辺かわからないような山が出てきます。左の大きい山が解析対象の山ですが、すぐ隣の山との境目のところから真下に線を引いてアバウトな境界を作ってそこまでを解析対象の面積を見なしても宜しいでしょうか?本来ならブロットのフィルムの方をベストの解析しやすいコンディションにするべきでしょうが、今回のケースにはいつも頭を悩まされています。具体的な解決方法がございましたら、ぜひともご教示をお願い申し上げます。

  • UVCカメラで16bitのモノクロ画像をキャプチャ

    UVCカメラは普通簡素なカメラを扱いますが,中には16bitのビット深さをもつモノクロカメラがあります.とはいえ,キャプチャソフトがビットを落としてしまったら元も子もないのですが,16bitの画像としてキャプチャできるフリーのUVC用ソフトってありませんか?ファイル形式はTiffとかにならざるを得ないでしょう.ImageJぐらい?もっと単純な手軽なものができたらほしいです.

  • 2つの画像の演算について

    今、imageJを用いて2つの画像を掛けたものを求めようと思っています。 その際に疑問に思ったのですが、 8bitのものと32bitの画像を掛けると答えが変になります。 bit数が違うとうまく計算できないのでしょうか?? あまりに初歩的な質問のせいか、検索してもいい答えが見つかりません。 もしご存知の方がいらっしゃいましたら、ご教授をお願い致します。

  • 画像のような順番で並んでいます。

    画像のような順番で並んでいます。 フィルタの順序を、曜日順(月火水木金土日)に設定したいのですがどうすればいいのでしょうか?

  • 8bitのjpegを16bitのtiffに変換

    8bitのjpegを16bitのtiffに変換に変更することは可能でしょうか? imageJというフリーソフトで65535を最高値としたヒストグラムを作成したいのですが、8bitのjpeg画像だと255が最高値になってしまいます。 そこで8bitのjpegを16bit(imageJで読み込める形式)に変換して、65535を最高値としたヒストグラムを作成することは可能でしょうか? フリーソフトで出来るのであれば、使用方法も含め、ソフト名を教えていただきたいです。

  • Photoshop7.0スライスの順番をかえたい

    Photoshop7.0を使用しているのですが、 画像をスライスツールで分割して、web用に保存、 この時にテーブルのセルを左列セルから下へ、そして左列下までいってから右(スライス画像A)の列へ、としたいのですが、 スライスが左、右(スライス画像A)、左セルへ戻り下へ、とよんでしまいます。 これは、スライス画像の順番と同じなので、そのせいだと思うのですが、その原因となっているスライス画像Aの順番(数字)をもっと後ろにするにはどうすればいいのでしょうか? スライスの順番を、スライスを引き直さず修正する方法を教えて下さい。