SCEのPS3を使った新薬開発のニュースについて

質問

http://www.nikkei.co.jp/news/sangyo/20061117AT1D1101P16112006.html
　いわゆるGridを使った蛋白質の解析ですが不思議に思うのは
新薬開発ならその構造とかが絶対に漏れてはならないということです。
いくらPS3が一般のPCとは違うといってもハッキングの可能性はないのでしょうか？専門家が集う展示会ではクラスターGridがどうやら本命のようです。どうしても外部に漏れる可能性を否定できないということでした。いったいどういうことなのでしょうか？スタンフード大学は暗号化して解析するようなことを考えているのでしょうか？それともPS3が
ゲーム機で一般のPCのようにハッキングされる可能性がないように設計されているのでしょうか？PS2のときからなぜGridに利用されないのか
不思議でしたがPS3には安全なセキュリティーが施されているのでしょうか？

回答No.3

wakwakps3

SETI@の解析は、電波望遠鏡で受信する宇宙からの電波(電磁波)の中に含まれる「人為的な信号」を調べて、どこから飛来しているのか確認を取るのが目的です。自然の出す電波は「一定の周波数」はまずありませんから、規則正しく出ている電波がキャッチできればいいのですが、実際は解析にかなりのマシンパワーが必要なので、「ボランティア」による解析に頼っています。

PS3のグリットコンピューティングは、次のようなものとも違います。
http://www.riken.jp/r-world/info/release/press/2006/060619/index.html
次の文に書かれていることが中心になります。

そして登場したのが、スタンフォード大学によるインターネットを活用した先進的なアイディア『折り畳みアットホーム』だ。折り畳みアットホームの目標は、タンパク質の折り畳み構造を研究するためのシステム作りにある。なぜタンパク質なのか。生物学的プロセスというものは、タンパク質の折り畳み構造に基づいているためだ。ときとしてタンパク質が不適切に折り畳まれることで、パーキンソン病からガンに至るまで、さまざまな種類の生物学的疾患が生じることがある。

　分散コンピューティングでは、プロセスを異なる部分に分割し、その処理を利用可能なCPU群に分配するといった手順で、タンパク質の折り畳み構造に関するデータを処理することができる。現在10万台以上のマシンが「タンパク質の折り畳み構造の謎を解く」作業に参加している。

　初めて分散コンピューティングが、あらゆる人の生命に影響を及ぼしうる研究において威力を発揮しつつある。タンパク質の折り畳み構造に関する十分なデータが集まれば、それを用いて絶望的な病気の治療法を研究することが可能になる。データがそろうのが早ければ早いほど、データを実際に活用した結果を出すのも早くなる。
・折り畳み解析について。
http://folding.stanford.edu/

以上のことから、<<折りたたまれている、たんぱく質の種類とその構造の解析>>です。新薬の開発には、各国の専門研究機関が「スーパーコンピューター」を使っていますから、PS3のグリットコンピューティングとは関係がありません。

回答No.2

wakwakps3

現在　同じようなグリットコンピューティングボランティア　SETI@に参加しています。

送られてくるのは、解析データの一部だけです。解析結果をハックしただけでは、どこの部分を解析しているのかはわかりません。まして、数万台のデータをハックするのは物理的に不可能でしょうから、警察に追われるのを覚悟でハックする意味が無いと思います。PS3のOSはRed Hat系の　Fedora Core 5か、yellow Dog Linux 5.0系です。12月になってやっとダウンロードが開始されましたが、日本語版はまだ代理店が販売日程を決めていないようです。

参考URL：

http://cell.fixstars.com/pukiwiki/index.php

お礼

もう少し調べたら
http://pr.fujitsu.com/jp/news/2004/10/1-1.html
という文献を見つけました。ここの背景のところに
＞最先端の創薬開発では、薬剤のターゲットとなるタンパク質と薬剤候補である分子がどれくらいの強さで結びつくのかを知ることが極めて重要です。また、現在の創薬開発は、実験を主体とするため、数十万から数百万とも言われる薬剤候補物質の中から効用のある薬剤を絞り込むには、一般に高価な試薬・装置を使用した上で10年以上にわたる研究が必要です。
とありました。すなわちターゲットとなる蛋白質(これが病気の原因？)
が決まっていてそれに数十万から数百万といわれる薬剤候補から絞り込むとあります。
　また下の課題のところには蛋白質自身も数千から数百万個の原子(アミノ酸？)で攻勢される大きな分子郡であるためとあります。
何種類かあるのでしょうか？
少し枝葉が違うだけでということは蛋白質にはあると思います。
どうなんでしょうか？

補足

まずは解答ありがとうございます。
さて、有名なSETI@の話が出てきたのでそれを例にしてみると、
宇宙人の会話が地球のどこかのデーターベースに一致するかを
調べるものだと認識しています。
　わたしもシロウトなのでよく分かりませんがこれを創薬に
ついて考えるとある有効と思われる物質が膨大な蛋白質のデーターベースと照合されて有効性を確認されるのではないかと思われるのですが？
すなわちその有効と思われる物質の構造とかが外に漏れるのでは？
　それともターゲットになる蛋白質が決まっていてそれに対して、いろいろな物質の有効性を調べるというのなら問題はないと思うのですが
どちらなんでしょう？
http://www.aist.go.jp/aist_j/organization/research_center/grid/grid_main.html
少し調べたら、
特定の疾病に対して薬効のある分子の探索を網羅的に行う薬物設計システム（Grid創薬）、DNAやタンパク質といった巨大分子のナノ構造を理解する量子化学計算への挑戦、表面や膜等のナノ構造体の高精度解析システムの構築、電子顕微鏡の遠隔利用とデータ解析システムの構築がある。このために、膨大な探索処理をグリッド上で効率よく実行できるツールキットの開発や複数の小さな分子に分割し分散協調して実行する手法、大規模計算科学のためのアルゴリズムの開発などを行っている。

とありました、つまりこれはGrid創薬にあたるのではないでしょうか？
SETI@の場合は図を見てもらえば分かりやすいのですが、巨大分子を分割してグリッド環境に掘り込む量子化学計算への挑戦に似ていると思いましたがいかがでしょう？

回答No.1

renton

素人考えですが、端末の一つがハッキングされて中身を解析されても、それ単体では何の意味もなさないのでは？
膨大な量の計算を元に結果が導き出されるのでしょうから、一部を見て何かがわかるって程の物じゃないと思います。

PS2は標準で内蔵ハードディスクやネットに接続できませんから、端末としては不十分です。
CPUもメモリの量も今となったら時代遅れですし・・・
PS3は汎用性が高いそうなので、いろいろ開発しやすいのではないでしょうか？
SonyピクチャーはPS3を映画などのCGのレンダリングで使用するそうです。

補足

http://pr.fujitsu.com/jp/news/2004/10/1
という文献を見つけました。ここの背景のところに
＞最先端の創薬開発では、薬剤のターゲットとなるタンパク質と薬剤候補である分子がどれくらいの強さで結びつくのかを知ることが極めて重要です。また、現在の創薬開発は、実験を主体とするため、数十万から数百万とも言われる薬剤候補物質の中から効用のある薬剤を絞り込むには、一般に高価な試薬・装置を使用した上で10年以上にわたる研究が必要です。
とありました。すなわちターゲットとなる蛋白質(これが病気の原因？)
が決まっていてそれに数十万から数百万といわれる薬剤候補から絞り込むとあります。
　また下の課題のところには蛋白質自身も数千から数百万個の原子(アミノ酸？)で攻勢される大きな分子郡であるためとあります。
何種類かあるのでしょうか？
少し枝葉が違うだけでということは蛋白質にはあると思います。
どうなんでしょうか？いずれにしても
ターゲットとなる蛋白質によって病気がある程度特定できたりするのではないでしょうか？