医療系雑誌におけるラマン分光法の応用とは？
- ラマン分光法を使用した医療系の研究について紹介しました。
- 病気による細胞と組織の分子組成の変化をラマンスペクトルで検知する方法が注目されています。
- ラマン分光法は非破壊で、染色や標識の使用を必要とせず、生体でも応用可能です。
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医療系雑誌の導入部分を和訳しました．どなたか添削して頂けないでしょうか
医療系雑誌の導入部分を和訳しました．どなたか添削して頂けないでしょうか． 07／26 QNo.6065829の続きです． 宜しくお願いします． In this in vitro study we have investigated whether this could in principle be accomplish by means of Raman spectroscopy. Raman spectroscopy is an optical method based on inelastic light attering. This technique provides detailed information concerning the molecular composition of under study as well as about molecular conformations and molecular interactions (Koningstein, 1971). Disease leads to changes in the molecular make-up of cell and tissues. The use of Raman spectroscopy for the development of diagnostic methods is based on the fact that these changes are reflected in the Raman spectrum. Depending on the application one can either explicitly extract information regarding molecular composition from the spectra, or one can use the spectra as highly specific optical spectroscopic fingerprints, by which tissues can be identified. The technique is highly suitable for in vivo application. It is nondestructive, it dose not rely on the use of dyes or labels and can be applied in vivo, e.g., through the use of dedicated fiberoptic probes (reviewed in Puppels et.al,2001). 本in vitro 研究において，我々は原則としてラマン分光法の測定により，それが達成できるか調査した．ラマン分光法は非弾性光散乱に基づいた光学的手法の一つである．この技術は，分子の構造および相互作用ばかりでなく，組織下部の分子の濃度に関する詳細な情報を提供する(Koningstein, 1971).疾病は細胞および組織の分子の組立の変化を引起す．診断方法の開発のためラマン分光法を使用することは，これらの変化がラマンスペクトルに反映されるという事実に基づいている．この技術は生体応用に非常に適している．これは非破壊であり，染色の使用あるいは標識をつけることを必要としないので，たとえば，専用の光ファイバープローブで生体に応用される．
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be accomplish >> be accomplished light attering >> light scattering . . . ですね。 本 in vitro （生体外での）研究において我々は、ラマン分光の手法で原理的にこれが達成できるか調査した。ラマン分光法は非弾性光散乱に基づいた光学的手法である。この技術は分子構造（配位）および分子相互作用ばかりでなく、調査している（ under study ）分子の組成に関する詳細な情報を提供する(Koningstein, 1971)。 疾病は細胞および組織の分子の組立の変化を引起す。診断方法の開発のためラマン分光法を使用することは，これらの変化がラマンスペクトルに反映されるという事実に基づいている。この方法によりスペクトルから分子組成に関して明確な情報を引き出すことも出来るし、そのスペクトルを（組織特有の）非常に特徴的な光学スペクトル特性（← fingerprints）として用いる事が出来、それによりどの組織かを特定する事も出来る。この技術は in vivo （生体内）への応用に非常に適している。染料や標識の使用を必要とせず、たとえば専用の光ファイバープローブを使えば非破壊的に利用できる（ 直訳 ： たとえば専用の光ファイバープローブを使えば非破壊的である。）
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- 添削してください．医学系論文の導入部分です．宜しくお願いします．
添削してください．医学系論文の導入部分です．宜しくお願いします． The objective of this in vitro study was to explore the applicability of Raman spectroscopy to distinguish basal cell carcinoma from its surrounding non-cancerous tissue; therefore, identifying possibilities for the development of an in vivo diagnostic technique for tumor border demarcation. Raman spectra were obtained in a two-dimensional grid from unstained frozen sections of 15 basal cell carcinoma specimens. 以下のように訳しました． 特に；therefore 以下がよく分かりません． この体外研究の目的は，基底細胞をそれ自身の正常細胞と識別するためのラマン分光法の適用（性）を調査（探索）することだった． このため，腫瘍の境界の境界設定に関する生体内での診断上の技術開発の関する確立 ラマンスペクトルは１５の基底細胞癌検体の染色していない冷凍切片から２次元格子（碁盤目）として得られた．
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- 医療系論文の和訳の添削（その３）
かなりの苦戦です．どなたか添削（解説）をお願いします． In all Raman maps BCC was clearly separated from its surrounding nontumorous tissue by the KCA. This was not the only distinction noticed. In a number of cases KCA resulted in several clusters of Raman spectra, within the tissue surrounding the tumor, reflecting regional variance in biochemical composition. In four Raman maps of nodular BCC, KCA formed separate clusters for dermis in the vicinity of the tumor (=50－150 mm) and dermis further away from the tumor (Fig 3a). The microscopic image shows a collagen-poor dermis immediately adjacent to the tumor (Fig 3b). The remaining Raman maps (11) did not show a similar distinction. In three of the 15 frozen sections a dense inflammatory infiltrate was present in the area of interest, resulting in a separate cluster of Raman spectra (Figs 3c,d). As Raman spectra are a direct reflection of the molecular composition of the tissue, a comparison (Fig 4). 全てのラマンマップにおいて，ＫＣＡを使用することよりＢＣＣは周辺の非腫瘍組織から明瞭に分離された．これはただの識別ばかりではない． いくつかのケースにおいて，ＫＣＡは 生化学的構成物ラマンスペクトルのそれぞれのクラスター（腫瘍周辺の組織を含め）に起因し，生化学的局部の変化を反映している． 小結節性ＢＣＣの４つのラマンマップにおいて，ＫＣＡは腫瘍の近接の真皮（５０～１５０ｍｍ）に関するスペクトルのクラスターを形づくった（図３ａ）． 顕微鏡画像は，腫瘍と直接に隣接したコラーゲンの少ない真皮を示す（図３ｂ）．残っているラマンマップ(11)は，同様の特色（鮮明度）を示さない．１５の冷凍薄片３つについて，極端な炎症性浸潤物が，関心の（興味の）領域に存在し，結果として生じるラマンスペクトルの独立したクラスター（図３c,d）．ラマンスペクトルは組織の分子の組成（構成）の直接的な反映なので，←？？
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- いつもお世話になっています．どなたか添削してください．
いつもお世話になっています．どなたか添削してください． 医療系雑誌の英文を和訳しました．宜しくお願いします．ちなみにQNo.6079855の続きです． Raman spectroscopy is increasingly being used for skin research and as the basis for the development of skin diagnostics. Insight in the molecular composition of the skin was provided by in vitro as well as in vivo Raman spectroscopy (Wiliams et al. 1994 Fendel 1997 Gniadecke et al. 1998 Caspars et al. 2001). This technique supplied in vivo evidence for the accumulation of H2O2 and L-phenylealanine in skin in vitiligo, supporting earlier observation concerning the pathophysiologic mechanism of this disease (Schallreuter et al. 1998,1999) Hata et al. (2000) used the technique to determine the carotenoid concentration in skin and reported that this concentration correlates with the presence or absence of skin cancer and preccancerous lesions. In a number of in vitro studies spectral differences have been reported between neoplastic tissue and normal tissue of the brain, breast, colon, larynx, and cervix (Mizuno et al. 1994 Frank et al. 1995; Mahadevan-Jansen et al. 1998; Stone et al. 2000). For both colon and breast tissue Raman spectroscopy was used to discriminate between histologically normal tissue and cancerous tissue (Manoharan et al. 1995; Frank et al. 1995) ラマン分光法は皮膚の研究さらには皮膚診断法開発にますます使用されている．in vivoおよびin vitroラマン分光法により皮膚の分子構造が考察された（Wiliams et al. 1994 Fendel 1997 Gniadecke et al. 1998 Caspars et al. 2001）．このin vivo技術により，皮膚の白斑中のＨ２Ｏ２およびＬ－フェニルアラニンの蓄積が示された．そしてこの技術はこの疾病の病態生理学的機構に関する診察の前に確証する（判定できる）（Schallreuter ET al.1998, 1999）．Hataら（2000）は皮膚中のカロチノイドの濃度を測定するためにこの技術を使用し、この（カロチノイド）の濃度が皮膚癌および前癌性病変の有無と相関関係にあるということの根拠を報告した．in vitro研究において、脳、胸部、結腸（大腸）、咽頭および頚部（首）の腫瘍性細胞と正常組織のスペクトルの差異が報告されている（Mizuno et al. 1994 Frank et al. 1995; Mahadevan-Jansen et al. 1998; Stone et al. 2000）．結腸（大腸）と胸部組織両方に関して、ラマンスペクトルは組織学的に正常な細胞と癌細胞を識別するために使用された（Manchran et al. 1995 Frank et al. 1995）．
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- 医療系雑誌の導入部分を和訳しました．どなたか添削して頂けないでしょうか
医療系雑誌の導入部分を和訳しました．どなたか添削して頂けないでしょうか． 宜しくお願いします． BBC is the most common cancer of the skin and, its incidence is ever increasing. The tumor most often appears in the head and neck region, particularly in Caucasians with a history of excessive sun exposure . Although slowly growing and rarely metastatic, BBC can cause significant local destruction. Histopathologic examination is gold standard for confirming the diagnosis. For most types of BBC, surgery is recommended as first-line treatment. A problem is presented by the fact that the tumor borders cannot be detected visually with 100% accuracy. This result in 5 y recurrence rate for primary BBC of 10.1% after simple surgical excision. Moh’s micrographic surgery is a technique that can detect tumor margins with approximately 100% certainty: 5 y recurrence rate are only 1 % for this surgical approach (Rowe et al, 1989). Moh’s micrographic surgery, however, is a time-consuming method, both for the pathologist and the surgeon, which prevents its widespread use. Real-time intraoperative in vivo determination of the tumor border would be a solution to this problem. ＢＢＣは最も一般的な皮膚癌で増加している． この腫瘍は頭部および頸部に，特に過大な太陽光の曝露暦のある白人に最も多く出現する．BBCは増殖しにくく転移しにくいとはいうものの，局部的には破壊を引き起こす．組織病理学的検査が確認診断の基準である． 典型的なBBCに関して，外科的処置は最も重要な処置として奨励される．腫瘍と（その）限界の境界が視覚的に１００％の精度で検出されないという事実により，課題は提案された．外科的切除の初期ＢＢＣの５年再発率は１０．１％である． Ｍｏｈの顕微鏡（画像）手術は, 約１００％の確実性で腫瘍の限界が検出できる手法である． ５年再発率は外科手術に関して１％にすぎない．しかしながら，Ｍｏｈの顕微鏡（画像）手術は, 病理学者および外科医の両方について時間を要する方法である．そしてそれはその普及した使用を妨害する．腫瘍の限界の生体検出に関するリアルタイム手術中はこの問題を解決するだろう．
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- 医療系論文の和訳です．添削をお願いすます
いつもお世話になっています．３番目の文が特に自信がありません．宜しくお願いします． RESULTS Raman pseudo-color maps In all 15 samples, obtained from 15 different patients, the pseudo-color Raman map and the microscopic image of the H&E stained sample were found to correlate very well. An example is shown in Fig 2. Figure 2(a) shows a pseudo-color Raman map of a BCC and the surrounding dermis, the area that was scanned measured 410×180 μm. The Raman map, which is the result of a KCA of the 3108 Raman spectra (see Materials and Methods) closely corresponds to the microscopic image of the H&E stained adjacent section (Fig 2b).It shows that the black area in the Raman map corresponds to tumor tissue; the white area corresponds to the surrounding tissue. The cluster averages of Raman spectra, collected from the scanned area are shown in Fig 2(c). There is a marked difference between the Raman spectra of BCC (spectrum 1) and surrounding tumor-free dermis (spectrum 2). 結果 ラマン疑似カラーマップ １５人の異なる患者から得られた全１５試料について，擬似カラーラマンマップとHE染色試料の顕微鏡イメージには良好な相関関係が見いだされた．実例を図２に示した．図２（ａ）はBCCおよび周囲の真皮の擬似カラーラマンマップを示し，その領域は正確に410×180μｍ走査された．3108のラマンスペクトルのKCA（材料と方法参照）の結果であるラマンマップは隣の欄に示したH&E染色の顕微鏡画像と厳密に一致した．（←少し意訳しました．） ラマンマップ中の黒い領域は腫瘍組織と一致し，白い領域は周辺の組織と一致した．ラマンスペクトルのクラスターの平均（そしてそれは、走査領域から選択されたものであるが）は図２ｃに示した．BCCのスペクトル（スペクトル１）と周辺の腫瘍を含まない真皮（スペクトル２）に著しい差がある．
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- 医療系論文の和訳の添削をお願いします． その２
QNo.6419993の続きです．図の説明文です． Figure 2. Comparison of microscopic image of BCC and pseudo-color Raman map with corresponding Raman spectra. Pseudo-color Raman map, based on Raman spectra obtained from a frozen tissue section of BCC. A Raman spectrum was obtained for each 10 ×10 μm2 pixel. KCA yielded two clusters corresponding to BCC and surrounding dermis as follows from a comparison with (b). H&E-stained thin section adjacent to the section used in the Raman experiment, showing nodular BCC (b1) and its surrounding tumor-free dermis (b2). The area shown corresponds to the area scanned in the Raman experiment. Cluster averaged Raman spectra from BCC (c1) and dermis (c2). To enhance the characteristic spectral features of BCC a difference spectrum BCC dermis (c3) was calculated. The dashed lines indicate bands in the difference spectrum that can be attributed to fatty acid represented here by oleic acid (c4) and DNA (c5). 図２ BCCの顕微鏡画像と対応するラマンスペクトルの擬似カラーラマンマップの比較 BCC凍結組織切片から得られたラマンスペクトルに基づく擬似カラーラマンマップ ラマンスペクトルはそれぞれ10 ×10 μm2の画素について得られた．KCAは以下に示す（ｂ）との比較から，BCCと真皮の２つのクラスターを与えた．ラマン実験に使用された部分と隣接するH&E染色箔切片は小結節性BCC(b1)およびその周囲の腫瘍のない真皮(b2)を示している．その領域はラマン実験で走査された領域と対応することを示した．クラスターはBCC(c1)および真皮(c2)由来のラマンスペクトルを平均した．BCCの典型的なスペクトルの特徴の精度を高めるために，BCC腫瘍の差スペクトル(c3)は計算された．ここで，点線はオレイン酸(c4)およびDNA(c5)により代表される脂肪酸と判断できる，異なるスペクトルのバンドを示す．
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- 医療系論文の和訳です．どなたか添削してください．
いつもながらしっくりしません． 宜しくお願いすます． Raman data For each sample, an area on the cryosection was selected for Raman measurements, containing BCC, dermis, and/or epidermis. This area was scanned in two dimensions using a step size of 10 mm. Laser light of 100 mW was focused on the tissue section to a spot of about 1 mm in diameter. The signal collection time for each pixel was 10 s, during which time the pixel area (of 10 ×10 mm2) was scanned through the laser focus so as to obtain a pixel-averaged Raman spectrum. The selected area varied from 0.05 mm2 (500 spectra) to 0.4 mm2 (4000spectra), depending on the size of the biopsy．Wave number calibration, subtraction of the background signal, cosmic ray removal, and intensity correction for the wave number dependent signal detection efficiency of the setup were performed as described previously (Wolthuis et al, 1999).Construction of Raman pseudo-color image In order to construct a pseudo-color image, spectra obtained from each sample were analyzed separately. Principal components analysis was performed on the Raman spectra, to orthogonalize and reduce the number of parameters needed to represent the variance in the spectral data set (Jollife, 1986). The first 100 principal components were calculated, typically accounting for more than 95% to up to 99% of the variation in the data set. 各試料について冷却部分（冷却区域）はBCCを含む真皮および／または上皮（表皮）をラマン測定のために選択された．領域は１０μｍのステップサイズを使用し，二次元で走査された．100ｍWのレーザ光は，直径１μｍのスポットサイズに（まで）組織切片に焦点を合わせた． ～ to a spot of about 1 μｍ in diameter. のtoの訳し方は？ 各画素に関する信号収集時間は１０秒だった．←？ 生検試料のサイズにより選択されたエリアは0.05mm２（500スペクトル）から0.4mm２(4000スペクトル)に変えられた．波数の校正および感度の補正 波数の校正，バックグランド信号の減算，宇宙線の除去および装置の波数に依存する信号検出効率に関する強度補正は，以前述べた（Wolthuisら1999）ように実行された． ラマン（擬）カラー画像の作図 擬カラー画像を作図するために，各試料から得られたスペクトルは別個に解析された． （別訳：擬カラー画像を解釈するために，各試料から得られたスペクトルは別々に解析された．←この場合は違うと思いますが…可能でしょうか） 主成分分析はスペクトルデータセットにおける変化を直行および説明するために必要されるパラメータの数を圧縮するためにラマンスペクトルに対して行われた（Jollife 1986）．
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- 英文（医療系論文）和訳です どなたか添削してくださ
いつもお世話になっています．今回は少し意訳も加えてみました．（ ）内が意訳ですが，相変わらずしっくりしません．宜しくお願いします． In this study, KCA was repeated with an increasing number of clusters, as long as the final cluster means showed differences clearly above noise level and the clusters contained more than 10 spectra. In this way, the optimal number of clusters can be determined that account for the variance in the tissue Raman spectra at the spatial resolution used in the Raman experiments. After KCA, a different color was assigned to each cluster. Each grid element of the Raman map was then assigned the color of the particular cluster to which its spectrum belonged. In this way a pseudo-color-image of the frozen section was created, in which areas with similar spectra had the same color. This pseudo-color image was then compared with the H&E-stained tissue section. 本研究において，ＫＳＡは最終的なクラスターの平均が，ノイズレベルの上の明らかな差異がみられる間，あるいは，１０スペクトル以上を含んでいる限りくり返された．（本研究において，クラスターの平均がノイズレベル以上の明らかな差異があるか，クラスターが１０スペクトル以上ある場合ＫＳＡをくり返した．） 本法において、クラスターの最適な数は、組織変化のラマンスペクトルの説明にラマン実験に使用したラマンスペクトルの空間分解能を決定できる．（本法において，組織変化説明のための実験に使用したラマンスペクトルの空間分解能はクラスターの数で決まる．） ＫＣＡの後，異なる色はそれぞれのクラスターに割振られた．（ＫＣＡの後，各クラスターに色を割りつけた．） 次に，ラマンマップの各格子素子はそれぞれの属するスペクトルの個々のクラスターの色に割振られた．（次に，各クラスターに割りつけた色で，ラマンマップの各格子素子を色づけした．） この方法において，凍結切片の擬似カラーイメージは作成されたが，類似スペクトルの領域は同じ色だった．擬似カラーイメージングはＨ＆Ｌ染色組織切片と比較された．（この方法で，凍結切片の擬似カラーイメージング（類似スペクトルの領域は同じ色で）を作成した．擬似カラーイメージングをＨ＆Ｌ染色した組織切片と比較した．）
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- 添削をお願いします．医療系論文の一部の和訳です．なかなか思ったような翻
添削をお願いします．医療系論文の一部の和訳です．なかなか思ったような翻訳になりません．宜しくお願いします． Sample preparation Excision specimens from 15 histologically proven BCC (12 nodular and three superficial), were obtained from 15 individuals from the outpatient clinic of the dermatology department of the University Hospital Rotterdam, after informed consent. A biopsy was taken from each sample, snap-frozen in liquid nitrogen and stored at ± 80°C until use. Cryosections (25 μm thickness) were obtained from the biopsy specimens and placed on CaF2 slides for Raman spectroscopy. At the time of spectroscopic investigation, the BCC sections were thawed to reach room temperature and allowed to dry in air. Areas of interest for Raman measurements (containing BCC, dermis, and/or epidermis) on unstained sections were identified on adjacent sections that were fixed in formalin and stained in hematoxylin and eosin (H&E). Reference spectra Reference spectra were obtained from calf thymus DNA, collagen type I, human placenta, and oleic acid. These compounds were purchased from Sigma-Aldrich (Sigma-Aldrich chemie,Zwijndrecht, the Netherlands) and ICN Biochemicals (Aurora, OH) and were used without further purification. Calf thymus DNA was dissolved in demineralized water (20 mg per ml). 試料の準備（調製） １５の組織分類的に立証されたＢＢＣ（小結節性12および上皮性３）の切除された検体は, インフォームドコンセント後、Rotterdaｍ大学病院皮膚科診療科の１５の個体（患者）から入手された．生体検査は,液体窒素中で急激に冷凍され,使用するまで－８０℃で保存された各サンプルから調べられた．凍結切片（２５μｍ厚）は生検材料から得られ，ラマン分光用のCaF2スライド上に置かれた．分光学的研究に際して、BCC切片は室温まであたためられ，次いで空気中で乾燥しなくてはならなかった．染色されていない部分のラマン測定（含むBCC、真皮および／または表皮）の興味の領域は、ホルマリンで固定され、そして、ヘマトキシリン－エオシン中で染色された補正部分について、識別（確認）された．（意味：ラマン測定の興味の対象である“ＢＣＣを含めた真皮および／あるいは表皮”は，ホルマリンおよびヘマトキシリン－エオシン処理されて識別された） 比較スペクトル比較スペクトルは子牛の胸腺ＤＮＡ、コラーゲンタイプIおよびオレイン酸から得られた．これらの化合物はシグマ・アルドリッチ（Zwigndrecht オランダ）およびＩＮＣバイオケミカル（オーロラ、オハイオ）から購入され、それ以上の精製なしに使われた．子牛の胸腺ＤＮＡは脱イオン水に溶かして使用した（２０ｍｇ／ｍｌ）．
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- 英文（医療系）和訳の添削をお願いします．
いつもながら，しっくりしません．どなたか添削してください． The principal components scores, obtained for each spectrum, were used as input for K-means clustering analysis (KCA). This clustering analysis algorithm was used to find groups of spectra with similar spectral characteristics (clusters). KCA was used, as this clustering method can easily handle large amounts of data like the Raman maps presented here (Jain and Dubes, 1988). In short KCA works as follows.First, the number of clusters in which the spectra are grouped by KCA, is defined by the user.For each of these clusters a spectrum is randomly chosen from the spectra in the data set, to act as the initial cluster center. All spectra in the data set are then compared with these cluster centers and assigned to the center that they most resemble. After all spectra are assigned to a certain cluster, new cluster centers are calculated by averaging all spectra assigned to that cluster.This procedure is repeated until a stable solution is reached. The principal components scores, obtained for each spectrum, were used as input for K-means clustering analysis (KCA). 各スペクトルから得られた主成分得点はK-mean クラスター分析（ＫＣＡ）のための入力情報として使われた．得たれたクラスター分析アルゴリズム（算法）は類似したスペクトルの特徴（クラスター：集団）のスペクトルを発見するために使われた．この方法（ＫＣＡ）はここで示されたラマンマップのような大量のデータを容易に処理することができるので，ＫＣＡは使われた(Jain and Dubes, 1988). 要約するとＫＣＡは以下のように作用（作動，機能）する．最初にＫＣＡによりグループ化されたスペクトル群のクラスターの数は使用者により規定された．このクラスターの１つのスペクトル，それぞれはデータセット中のスペクトル群から無作為に選ばれる．次いで，セータセット中の全てのスペクトルは，これらのクラスターの中心的存在と比較され，（そして）最も似ているクラスターに割当られる．最終的に全てのスペクトルは確信できるクラステーに割当られ，新しいクラスターの中央（値？）はそのクラスターに割当られた全てのスペクトルの加算平均により計算されこの手順は安定するまで繰り返され，（この手順が）達成される．
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お礼
kn-coro さん．丁寧な回答ありがとうございます．（恥ずかしいことですが，ご指摘のように２箇所に入力ミスがありました．） …調査している（ under study ）など，括弧つきの回答はとても参考になりました．もう一度訳し直してみます．
補足
kn-coro さん．ｋａｓｕｄａｋｏです．訳し直して見ました． よい勉強になりました． ありがとうございます．