- ベストアンサー
アガロースゲル電気泳動について
アガロースゲル電気泳動についてで、分子量が等しいもので、直鎖状DNA、環状DNA(超らせんを持つものと持たないものの二種類)の三種類で電気泳動を行ったところ、泳動速度の速さはどのような順番になるのでしょうか？ また、環状DNAの場合、超らせんをもつものともたないもの以外の分類みたいなものはあるのでしょうか？
- katoudesu8
- お礼率30% (188/623)
- 科学
- 回答数1
- ありがとう数4
- みんなの回答 （1）
- 専門家の回答
質問者が選んだベストアンサー
早い順に 超螺旋型（スーパーコイルド） 直鎖状（リニアー） 環状（オープンサーキュラー） になります。ただ、直鎖と環状はほとんど違いませんが ＞超らせんをもつものともたないもの以外の分類みたいなものはあるのでしょうか？ それは知りません（聞いたことありません）、ごめんなさい
関連するQ&A
- アガロースゲル電気泳動で
ちわっす！ 答え魔ぽんたくんでっす♪ 今日は困ったコトがあって、投稿しました。 DNAマーカー（λ/HindIII）を1％アガロースゲルで電気泳動してるんだけど、DNAが高分子の部分でスメア状のバンドを作って上手く分離できません！！ (DNAがすべて、高分子エリアにスメア状バンドとして集まってしまいます) （T_T） 泳動バッファなどの試薬は調製済みのメーカー製プレミックス品を使っているので、試薬の組成は合ってます。 希釈率にもミスはありませんでした。 この場合、どのような原因が考えられますか？ ＜条件＞ ・泳動バッファ（TAEバッファ） ・ゲル（1×TAEバッファでアガロースを溶解した1％ゲル） ・電圧＆時間（50ｖ,90分） ・DNA量（100ng,10ng,3ng,1ng,300pg）
- ベストアンサー
- 生物学
- アガロースゲル電気泳動について
アガロースゲル電気泳動について調べているのですがアガロースゲルの分子構造がイマイチわかりません。いろいろなサイトで調べてみたのですが、載っていなかったので、もし、いいサイト等あったら教えてください。
- ベストアンサー
- 化学
- アガロースゲル電気泳動
PCR法で処理したDNAをアガロースゲル電気泳動をしました。 レーン１ DNA分子量マーカー（１Kｂｐ） レーン２～レーン４ PCR産物１ レーン５ DNA分子量マーカー（１００ｂｐ） レーン６～レーン８ PCR産物２ レーン１からレーン４はアプライする時にゲルにさしてしまいました。 レーン５～レーン８はアプライは綺麗にはいりました。 結果はレーン１からレーン４まではバンドが見えたが、レーン５はライトにあてるとやっとなんとか見える程度で、レーン６～レーン８は何も見えなかった。 レーン６からレーン８はPCR産物２を入れ忘れたと考えられるが、レーン５の分子量マーカーがきちんとでなかった理由がわかりません。 どのような理由が考えられるでしょうか？ またアプライするときにゲルにさしてしまったことで、さしてない方に影響出たりはするんでしょうか？
- 締切済み
- 生物学
- アガロースゲル電気泳動
現在、実験でアガロースゲルを用いて電気泳動を行なっています。 しかし、ポジティブコントロールは毎回バンドがでるのですが、目的とするバンドの方は、帯状にPCR産物が流れた跡のようなものが出るのみで、バンドが出なくなってしまいました。 1ヶ月くらい前まではきちんとバンドが出ていたので、プライマーの設計ミスでもなさそうなのですが、何が原因なのか分からず困っています。 PCRをかける前のDNAは10ng/μLで、実際電気泳動で流しているDNA濃度は測定していないため、分かりません。 ちなみに電気泳動の条件は以下のとおりです。 ・ゲル：1.5%アガロースゲル ・電圧：100V どなたか知恵を貸してください。 実際の電気泳動後の写真は、 http://oshietegoopcrdenkieidou.rakurakuhp.net/ に載せました。 よろしくお願いします。
- 締切済み
- 生物学
- アガロースゲル電気泳動について
薬剤師国家試験95回問28に以下のような質問がありました。 「以下の問題の正誤を答えよ。 b. アガロースゲル電気泳動でDNAが分子サイズによって分離できるのは、DNAごとに単位電荷当りの質量が異なるからである。」 問題集の解答を見たところ、「DNAの構成単位であるヌクレオチドは塩基、糖（2-デオキシリボース）、リン酸から構成されており、電荷を持つのはリン酸部分である。このため、ヌクレオチド１個につき電荷１個となり、DNA全体としてはヌクレオチドの増加とともに電荷も増大するため、単位電荷当りの質量はDNA鎖の長さに関係なくほとんど変わらない。このため、DNAはアガロースゲルの持つ比較的大きな網目構造を利用する事で、分子サイズの違いにより分離することが出来る。」とありました。 ここで、疑問がわきました。解答に「DNA鎖の長さに関係なく」とありますが、DNA鎖の長さ（ヌクレオチドの長さ）が変われば、質量は変わりませんか？以上の点がよく分からない点です。ご存知の方がおられましたら、ぜひ教えていただけると幸いです。よろしくお願いいたします。 なお、自分で「DNAの構成単位であるヌクレオチドは塩基、糖（2-デオキシリボース）、リン酸から構成されており、電荷を持つのはリン酸部分である。そして、DNAの場合、電荷の大きさは分子の大きさに比例する。よって、DNAのサイズの小さいものは全体の電荷は小さく、DNAのサイズの大きいものは全体の電荷は大きい。しかし、同じ質量で比べたときの電荷の大きさ（単位質量当りの電荷）はどのDNAでも等しい。よって、単位電荷当りの質量はどのDNAでも等しい。よって、このため、DNAはアガロースゲルの持つ比較的大きな網目構造を利用する事で、分子サイズの違いにより分離することが出来る。」という考えは思いつきましたが、上記の解答のようないきなり、「単位電荷当りの質量はどのDNAでも等しい」と導くやり方がよく分かりません。よろしくお願いします。
- ベストアンサー
- 生物学
- アガロースゲルによる電気泳動の距離測定
実験にて電気泳動によるDNAの測定をするので予習的に調べていた所、いくつかの疑問点が解消できなかったので質問させて頂きます。 分子量によって泳動距離に差が出る、同じなら同じ距離だけ移動するという基本は理解できましたが、 仮に分子量が近く一本の線同士二つを見比べて微妙な差により判断が困難な場合、（開始地点から5.00cmと5.04cm等） この二つが同一か異質かどのように判断すべきなのでしょうか。 差がAミリ未満は同一と判断してよいといった基準があるのでしょうか？
- 締切済み
- 生物学
お礼
回答ありがとうございます。