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数値地図の海岸線の抽出と接続

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国土地理院の地形図の「「数値地図25000」から特定の島、たとえば
石垣島の海岸線を抽出して、複数の図葉に別れているせいで切れている
海岸をつないで、島として完全な海岸線を作ってデータとして保存できる
ソフトがあれば有料・無料を問わずすべて教えてください。

利用する側にとってさらに都合良いのは、島全体の完全な海岸線が
提供されているdatabaseのありかです。これがあればそのまま
利用すれば良いのでソフトの困り事とではなくなりますね。

海岸線だけを抽出するソフトはありますが、島として完全になるよう
につなぐ機能がありません。論文用の海洋生物の分布地図を
作るのに使います。
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