複数スクリプトの読み込みでlightboxが動作しません
MT4.1でサイトを構築し、カレンダー、サイト内検索、画像表示（lightbox）をprototype.jsを用いたスクリプトを読み込む形で動かそうとしているのですが、画像表示（lightbox（最新版））のみを読み込ませた場合は動作するのですが、三種類とも読み込ませた場合画像表示（lightbox）が正常に動作せず、拡大画像のページに移動してしまいます。
ヘッダ内に組み込んでいるソースは下記となります。
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<!-- カレンダー表示 -->
<script type="text/javascript" src="<$MTBlogURL$>_ajax/calendar/prototype.js"></script>
<script type="text/javascript" src="<$MTBlogURL$>_ajax/calendar/ajaxCalendar.js"></script>
<script type="text/javascript" src="<$MTBlogURL$>_ajax/calendar/dayChecker.js"></script>
<!-- カレンダー表示 -->
<!-- lightbox -->
<link rel="stylesheet" href="<$MTBlogURL$>_ajax/lightbox/css/lightbox.css" type="text/css" media="screen" />
<script src="<$MTBlogURL$>_ajax/lightbox/js/prototype.js" type="text/javascript"></script>
<script src="<$MTBlogURL$>_ajax/lightbox/js/scriptaculous.js?load=effects,builder" type="text/javascript"></script>
<script src="<$MTBlogURL$>_ajax/lightbox/js/lightbox.js" type="text/javascript"></script>
<!-- lightbox -->
<!-- 検索窓処理 -->
<script type="text/javascript" src="<$MTBlogURL$>_ajax/search/js/prototype.js"></script>
<script type="text/javascript" src="<$MTBlogURL$>_ajax/search/js/blog_ajax_json_search.js"></script>
<!-- 検索窓処理 -->
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画像表示（lightbox）のみにすると動作するので、他のスクリプトと衝突しているのだとは思いますが読み込みの順番などを変更しても効果がありませんでした。
解決策をご存知の方、ご教授をお願いいたします。
補足
talooさん、ご回答ありがとうございます。 表記いただいたスクリプトはファイル内のどこに挿入すればよろしいでしょうか？ お手数ですが、ごらんになりましたら、ご回答お願いします。